About: Molecular typing of Treponema pallidum subsp. pallidum strains and isolates: the background for epidemiological and clinical identifications of individual strains

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Molecular typing of Treponema pallidum subsp. pallidum strains and isolates: the background for epidemiological and clinical identifications of individual strains Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=NR8967
Description	The main aim of this project is to collect over one hundred strains and clinical isolates of T. pallidum ssp. pallidum, the causative agent of syphilis. Variable parts of the genomes will be amplified and sequenced. Molecular identification of individual Treponema pallidum ssp. pallidum strains and isolates is important for epidemiologic consequences and for clinical discrimination between reinfection and reactivation of the syphylitic process. (en) Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu. Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR amplifikace a RFLP.
Title	Molecular typing of Treponema pallidum subsp. pallidum strains and isolates: the background for epidemiological and clinical identifications of individual strains (en) Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
skos:notation	NR8967
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Branch programm of research of the Ministry of Health
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NR8967/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NR8967/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2011-04-27 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65803499
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	NV - Aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového výzkumu (tzv. %22neprůmyslový výzkum%22)
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Treponema pallidum; comparative genomics; PCR diagnostics; SNP (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Lékařská fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	50 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	50 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-12-18 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/NR8967-4%2F2006
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMZ02006NR
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2006-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	18 type strains of genus Treponema and 389 clinical specimens from 252 patients were collected. Type strains were analysed by whole genome fingerprinting and MLST.Clinical samples were tested for treponemal DNA. New typing scheme was developed. (en) Bylo shromážděno 18 typových kmenů rodu Treponema a 389 klinických vzorků od 252 pacientů. Typové kmeny byly vyšetřeny metodou whole genome fingerprinting a MLST, klinické vzorky vyšetřena přítomnost DNA. Navržen nový typovací systém pro klinické vzorky. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Treponema pallidum comparative genomics PCR diagnostics
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2 Určovanie genómovej sekvencie Treponema pallidum subspecies pallidum kmeňa Dallas 1 Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subspecies pertenue CDC-2 Clarithromycin treatment failure due to macrolide resistance in Treponema pallidum in a patient with primary syphilis. Genome analysis of Treponema pallidum subsp. pallidum and subsp. pertenue strains by whole genome fingerprinting: most of the genetic differences are localized in six genomic regions. Detection of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14 from Skin Lesions,Serum, and CSF in an Infant with Congenital Syphilis after Clindamycin treatment of the mother during pragnancy. Comparative pathogenomics of spirochetes. Genome Differences between Treponema pallidum subsp. pallidum Strain Nichols and T. paraluiscuniculi Strain Cuniculi A Pyrosequencing as a tool for whole genome sequencing of Treponema pallidum subspecies. Detection of Treponema pallidum DNA from the Serum of an Adequately Treated Patient with Latent Syphilis. Klinický materiál pro průkaz syfilis metodou polymerázové řetězové reakce. Diagnosis of syphilis by polymerase chain reaction and molecular typing of Treponema pallidum Detection of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14 from Skin Lesions, Serum, and CSF in an Infant with Congenital Syphilis after Clindamycin Treatment in Pregnancy Detection of treponema pallidum DNA in the serum of an adequately treated patient with latent syphilis Testování kandidátních lokusů pro typizaci klinických izolátů Treponema pallidum Performance of CAPTIA SelectSyph-G enzyme-linked immunosorbent assay in syphilis testing of a high-risk population: analysis of discordant results. Simian isolate of Treponema pallidum Fribourg-Blanc: mapping the genome differences. Treponema pallidum ssp pallidum and its detection in clinical material Analýza sigma-54 závislých promotorů spirochety Treponema pallidum. Laboratorní diagnostika syfilis Kompletní genomová sekvenace kmene Treponema pallidum subsp. pertenue Samoa D: srovnání pyrosekvencování a komparativní genomové sekvenace Laboratorní diagnostika syfilis. Macrolide treatment failure in a case of secondary syphilis: a novel A2059G mutation in the 23S rRNA gene of Treponema pallidum subsp pallidum Syfilis u pacientů označovaných jako %22men having sex with men%22 - význam přímého průkazu metodou PCR Detekce původce syfilis Treponema pallidum subsp. pallidum v klinických vzorcích. Comparison ot the syphilis and yaws spirochete genomes: comparative genome sequencing of T. pallidum ssp. pallidum Samoa D. Molekulárně-biologická diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu. Molekulární detekce a typizace Treponema pallidum subsp. pallidum v klinickém materiálu. Srovnání pyrosekvenování a komparativní genomové sekvenace u Treponema pallidum subsp. pertenue Samoa D. Spirillum Treponema pallidum and its detection in clinical material Srovnání tří celogenomových sekvenačních metod při sekvenaci genomu Treponema pallidum subspecies pertenue Samoa D Diagnostika časné syfilidy metodou PCR - přínos pro klinickou praxi. Srovnání komparativní genomové sekvenace a pyrosekvenace u Treponema pallidum subspecies pertenue Samoa D Celogenomové sekvenační metody: srovnání 3 metod při sekvenaci genomu Treponema pallidum subspecies pertenue Samoa D. Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum. Komparativní genomová sekvenace (CGS) kmenů rodu Treponema. Komparativní genomika patogenních kmenů T. pallidum. PCR diagnostika a molekulární typizace původce syfilis: aktuální problémy PCR detekce. A novel Treponema pallidum antigen, TP0136, is an outer membrane protein that binds human fibronectin. Complete genome sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum strain SS14 determined with oligonucleotide arrays Whole genome sequencing of pathogenic and nonpathogenic treponemes: comparison of syphilis and yaws strains with T. paraluiscuniculi. Detekce a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum subsp. pallidum v biologických vzorcích Diagnostika časné syfilis metodou PCR - klinická charakteristika vyšetřovaných a význam vyšetření. Diagnostika a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum v klinickém materiálu. Sekvenace heterologních oblastí genomu T. pallidum sussp. pertenue kmene Samoan D: cesta ke kompletní genomové sekvenci původce yaws. Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema. PCR detection and typing of tribal spirochetes Treponema pallidum in biological material Sequencing and molecular typing of hypervariable loci in the Treponema pallidum genomes: characterizations of type strains and clinical isolates Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema. Diagnostics of Treponema pallidum in clinical material
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2007/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2007/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2008/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2008/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2009/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2009/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2010/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2010/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2006/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2006/orjk%3A14110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software