| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - Cíl: Stanovit rozdíly mezi genomy čtyř blízce příbuzných spirochet rodu Treponema metodou DNA fingerprintingu. Materiál a metody: Byly vyšetřeny kmeny Nichols, SS14 (T. p. pallidum), Samoan D (T. p. pertenue) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi). Na základě kompletní nukleotidové sekvence kmene Nichols byly genomy vybraných zástupců rozděleny do 97 překrývajících se intervalů; intervaly byly amplifikovány a štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Restrikční profily jednotlivých kmenů byly srovnány a použity k identifikaci heterologních oblastí. Rozdíly v genomech byly soustředěny zejména do skupiny tpr genů a do skupiny hypotetických genů, které se nacházejí v jejich blízkosti. Ukazuje to na možnost, že rozdílná virulence treponemálních kmenů je podmíněna relativně malými odlišnostmi v příslušných genomech. Identifikovaných nukleotidových záměn lze využít při molekulární identifikaci treponemálních kmenů a izolátů.
- Cíl: Stanovit rozdíly mezi genomy čtyř blízce příbuzných spirochet rodu Treponema metodou DNA fingerprintingu. Materiál a metody: Byly vyšetřeny kmeny Nichols, SS14 (T. p. pallidum), Samoan D (T. p. pertenue) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi). Na základě kompletní nukleotidové sekvence kmene Nichols byly genomy vybraných zástupců rozděleny do 97 překrývajících se intervalů; intervaly byly amplifikovány a štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Restrikční profily jednotlivých kmenů byly srovnány a použity k identifikaci heterologních oblastí. Rozdíly v genomech byly soustředěny zejména do skupiny tpr genů a do skupiny hypotetických genů, které se nacházejí v jejich blízkosti. Ukazuje to na možnost, že rozdílná virulence treponemálních kmenů je podmíněna relativně malými odlišnostmi v příslušných genomech. Identifikovaných nukleotidových záměn lze využít při molekulární identifikaci treponemálních kmenů a izolátů. (cs)
- Whole genome fingerprinting was used to compare four treponemal strains including Nichols and SS14 (T. p. pallidum), Samoan D (T. p. pertenue) and Cuniculi A (T. paraluiscuniculi). T. p. pallidum is the causative agent of sexually transmitted syphilis, T. p. pertenue causes endemic non-venereal treponemal infections and T. paraluiscuniculi is the etiologic agent of venereal syphilis in rabbits and does not infect humans. The different degrees of invasivity and pathogenicity of these strains should correspond to the differences in their genomes. The genomes of analysed strains were divided into 97 overlapping intervals covering the whole genome and each of these segments was amplified and digested by restriction enzymes BamH I, EcoR I and Hind III. The genome differences are preferentially localized in the vicinity of tpr genes. (en)
|
| Title
| - Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema.
- Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema. (cs)
- Restriction mapping of closely related treponemal genomes (en)
|
| skos:prefLabel
| - Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema.
- Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema. (cs)
- Restriction mapping of closely related treponemal genomes (en)
|
| skos:notation
| - RIV/00216224:14110/06:00016084!RIV10-MZ0-14110___
|
| http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
| http://linked.open...avai/riv/aktivity
| - P(GA310/04/0021), P(NR8967), Z(MSM0021622415)
|
| http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
| http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
| http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open...titaPredkladatele
| |
| http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
| http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/00216224:14110/06:00016084
|
| http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - Restriction mapping; treponemal genomes (en)
|
| http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
| http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
| http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
| http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
| http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
| http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Strouhal, Michal
- Šmajs, David
|
| http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
| |
| http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)