About: Characterization of a novel protein complex involved in RNA processing and editing in the mitochondrion of Trypanosoma brucei     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • RNA editing is required for maturation of mitochondrial (mt) mRNAs in Trypanosoma brucei, a process involving the 20 S editosome protein complex and guide (g) RNAs. Tandem affinity purification of the RNA-binding protein TbRGG1, involved in this process, led to the discovery of a novel macromolecular complex.  This complex has been provisionally named the mitochondrial RNA binding complex 1 because some putative subunit proteins contain motifs implicated in RNA metabolism. Preliminary results with RNAi knockdown cell lines of three subunits indicate that this complex may be a collection of sub-complexes with various roles in mt RNA processing. One such role seems to be gRNA processing/transcription, which is still a mysterious process. In addition, one of these subunits seems to be closely associated with mt DNA by immunofluorescence experiments, which is consistent with this idea. We propose to further define the compositions and functions of the associated complexes. We will focus attention on the complex with an apparent role in gRNA expression. (en)
  • Editování RNA u bičíkovce Trypanosoma brucei je proces nezbytný pro zrání mitochondriálních (mt) mRNA. Jeho klíčovou součástí je proteinový komplex označovaný jako 20S editosom a molekuly guide (g) RNA. RNA-vážící protein TbRGG1 se tohoto procesu rovněž zúčastní a jeho afinitní purifikace nám umožnila objev nového makromolekulárního komplexu. Jelikož mají některé součásti tohoto komplexu motivy svědčící pro jejich funkci v metabolismu RNA, označujeme jej dočasně jako „mitochondriální RNA-vážící komplex 1“. Předběžné výsledky s RNA interferencí proti třem jeho podjednotkám naznačují, že se jedná o sadu subkomplexů s různými funkcemi při úpravě mt RNA, včetně přepisu a úprav gRNA. Účast v tomto velmi málo známém procesu navíc naznačují výsledky získané protilátkou proti podjednotce komplexu, které jej lokalizují do definované oblasti v těsné blízkosti mt DNA. Cílem této žádosti je přesný popis složení tohoto komplexu a poznání funkcí proteinů, které ho vytváří. Zaměříme se zejména na funkce související s přepisem gRNA.
Title
  • Characterization of a novel protein complex involved in RNA processing and editing in the mitochondrion of Trypanosoma brucei (en)
  • Charakterizace nového proteinového komplexu účastnícího se editování a úprav RNA v mitochondrii Trypanosoma brucei
skos:notation
  • GA204/09/1667
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...hodnoceniProjektu
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • mitochondrion; trypanosoma; RNA; editing; RNA; interference; protein; complex (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...jektu+dodavatelem
  • Realization of grant produced unique outcome, 23 publications in scientific journals with IF (total IF of journals is 116.7). This project led to the identification and subsequent characterization of a novel RNA-editing protein complex MRP1 that is now being intensely studied by several laboratories and is considered as one of the potentially promising drug targets for human pathogen T. brucei. (en)
  • Výstupy grantu jsou naprosto unikátní (23 publikací v časopisech s IF o celkovém impaktu 116,7. Projekt vedl k popisu a následné charakterizaci nového RNA-editing proteinového komplex MRP1, který je v současnosti považován za důležitý cíl možného terapeutického zásahu. Řešení grantu vedlo dále ke pochopení funkce a řízení mitochondriálních proteinů důležitého lidského patogena, Trypanosomy brucei. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
  • mitochondrion
  • RNA
  • editing
  • interference
  • protein
  • trypanosoma
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software