About: Binding of tumor suppressor protein p53 to DNA. Effect of DNA supercoling and protein postsynthetic modification

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Binding of tumor suppressor protein p53 to DNA. Effect of DNA supercoling and protein postsynthetic modification Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA4004110
Description	The proposed project is oriented towards the research of the tumor suppressor protein p53 and its binding to DNA. Better understanding of this key protein is essential for rationalizing its role in the development of cancer. The proposed studies are directed at: (i) the effect of postsynthetic modifications of the p53 protein on its binding to DNA and particularly to supercoiled DNA, (ii) the effect ofthe DNA superhelix density on p53 binding, (iii) the effect of supercoiling on the sequence-specific binding of p53 to different concensus sequences within the circular covalently closed plasmid DNA, (iv) adsorption/desorption properties of short peptides of p53 specifically phosphorylated at biologically important amino acid residues. Proposed model studies of adsorption of these peptides at electrically charged surfaces should contribute to a better understanding the effects of phosphorylation on properties of the complex p53 protein molecules and on p53 binding to DNA. (en) Navržený projekt je orientován na výzkum nádorového supresoru proteinu p53 a na otázky jeho vyzby na DNA. Výzkum tohoto klíčového proteinu je nezbytný pro pochopení jeho mnohonásobných funkcí v buňce a jeho úlohy při vývoji rakoviny. Navržené studie jsou zaměřeny na: (i) vliv postsyntetických modifikací na vazbu tohoto proteinu na DNA a zvláště na nadšroubovicovou DNA, (ii) vliv superhelikální hustoty DNA navazbu p53, (iii) vliv nadšroubovicového vinutí na sekvenčně-specifickou vazbu p53 na různé cílové sekvence obsažené v kovalentně uzavřených kroužcích plasmidové DNA, (iv) adsorpčně/desorpční vlastnosti krátkých peptidů p53, specificky fosforylovaných na biologicky významných zbytcích aminokyselin ve srovnání s nefosforylovanými peptidy. Domníváme se, že modelové studie adsorpce těchto peptidů na elektricky nabitých površích přispějí k lepšímu poznání vlastností komplexních molekul proteinu p53 i vlivu fosforylace na tyto vlastnosti a na vazbu p53 na DNA.
Title	Binding of tumor suppressor protein p53 to DNA. Effect of DNA supercoling and protein postsynthetic modification (en) Vazba nádorového supresoru proteinu p53 na DNA. Vliv superhelicity DNA a postranslační modifikace proteinu.
skos:notation	IAA4004110
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA4004110/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA4004110/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-09-26 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	1714788
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	tumor suppressor protein p53; binding of p53 to supercoiled DNA; effect of p53 postsynthetic modification on DNA binding; electrochemistry of peptides; p53 core and C-terminal domains (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	2 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2004
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2001
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2005
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2005
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV0-AB2001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie FD - Onkologie a hematologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Vazba nádorového supresoru proteinu p53 na DNA je stimulována její superhelicitou, jak u vazby sekvenčně nespecifické, tak i specifické. V této vazbě hrají specifickou roli centrální a C-koncová doména p53 a posttranslační modifikace tohoto proteinu. (cs) DNA binding of the tumor suppressor protein p53 is stimulated by DNA supercoiling both in sequence-specific and non-specific interactions; Specific roles are played by the central and C-terminal domains and posttranslational modification of the protein. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	binding of p53 to supercoiled DNA electrochemistry of peptides tumor suppressor protein p53 effect of p53 postsynthetic modification on DNA binding
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Sequestering of p53 into DNA-protein filaments revealed by electron microscopy Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercoiling Determination of glutathione-S-transferase traces in preparations of p53 C-terminal domain (aa320-393). New ELISA technique for analysis of p53 protein/DNA binding properties. Electrochemical Study of Heavy Metals and Metallothionein in Yeast Yarrowia lipolytica Role of tumor suppressor p53 domains in selective binding to supercoiled DNA.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2001/ico%3A00209805 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2001/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2002/ico%3A00209805 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2002/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2003/ico%3A00209805 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2003/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2004/ico%3A00209805 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2004/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2005/ico%3A00209805 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2005/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2007/ico%3A00209805 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4004110/2007/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 89 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software