About: The Leishmania donovani complex: Genotypes of five metabolic enzymes (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), new targets for multilocus sequence typing     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Komplex Leishmania donovani se skládá z L. donovani, L. infantum a L. archibaldi, ačkoli posledně jmenovaný zástupce není považován za validní druh. Rozlišení leishmánií na základě morfologie není možné; používají se biochemické, imunologické a molekulárně biologické přístupy. Multilokální enzymová elektroforéza (MLEE) je v současnosti tzv. zlatým standardem. Sekvenovali jsme geny kodující 5 metabolických enzymů používaných pro MLEE, a to pro rozlišení DNA diverzity příslušných isozymů a rovněž pro posouzení jejich vhodnosti pro multilokální sekvenování na bázi PCR. U 17 kmenů L. infantum, 7 kmenů L. donovani a 3 kmenů L. archibaldi byly sekvenovány geny pro isocitrate dehydrogenázu, jablečný enzym, manosofosfát isolerázu, glukoso-6-fosfát dehydrogenázu a fumarát hydratázu. Fylogenetická analýza založená na 263 kb protein-kodujících sekvencí ukázala silnou korelaci mezi genotypem a geografickým původem. Evropa a Afrika představují na základě našich výsledků nezávislá evoluční centra. (cs)
  • The complex Leishmania donovani is comprised of L. donovani (LD), L. infantum (LI) and L. archibaldi (LA). Morphological distinction of species is impractical, so biochemical, immunological and DNA-based criteria were introduced. Multilocus enzyme electrophoresis (MLEE) is the present gold standard. We have sequenced the genes encoding 5 metabolic enzymes used for MLEE, both to resolve the DNA diversity underlying isoenzyme mobility differences and to explore the potential of these targets for higher resolution PCR-based multilocus sequence typing. The genes sequenced were isocitrate dehydrogenase, malic enzyme, mannose phosphate isomerase, glucose-6-phosphate dehydrogenase, and fumarate hydratase, for 17 LI strains, 7 LD strains , and 3 LA strains. Phylogenetic analysis of a concatenated alignment based on a total of 263 kb protein-coding sequences showed strong correlation of genotype with geographical origin. Europe and Africa appear to represent independent evolutionary centres.
  • The complex Leishmania donovani is comprised of L. donovani (LD), L. infantum (LI) and L. archibaldi (LA). Morphological distinction of species is impractical, so biochemical, immunological and DNA-based criteria were introduced. Multilocus enzyme electrophoresis (MLEE) is the present gold standard. We have sequenced the genes encoding 5 metabolic enzymes used for MLEE, both to resolve the DNA diversity underlying isoenzyme mobility differences and to explore the potential of these targets for higher resolution PCR-based multilocus sequence typing. The genes sequenced were isocitrate dehydrogenase, malic enzyme, mannose phosphate isomerase, glucose-6-phosphate dehydrogenase, and fumarate hydratase, for 17 LI strains, 7 LD strains , and 3 LA strains. Phylogenetic analysis of a concatenated alignment based on a total of 263 kb protein-coding sequences showed strong correlation of genotype with geographical origin. Europe and Africa appear to represent independent evolutionary centres. (en)
Title
  • The Leishmania donovani complex: Genotypes of five metabolic enzymes (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), new targets for multilocus sequence typing
  • The Leishmania donovani complex: Genotypes of five metabolic enzymes (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), new targets for multilocus sequence typing (en)
  • Komplex Leishmania donovani: genotypy pěti metabolických enzymů (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), nových cílů multilokálního sekvenčního typování (cs)
skos:prefLabel
  • The Leishmania donovani complex: Genotypes of five metabolic enzymes (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), new targets for multilocus sequence typing
  • The Leishmania donovani complex: Genotypes of five metabolic enzymes (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), new targets for multilocus sequence typing (en)
  • Komplex Leishmania donovani: genotypy pěti metabolických enzymů (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), nových cílů multilokálního sekvenčního typování (cs)
skos:notation
  • RIV/60077344:_____/07:00087493!RIV08-AV0-60077344
http://linked.open.../vavai/riv/strany
  • 149;160
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(2B06129), R, S, Z(AV0Z60220518), Z(MSM6007665801)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
  • 2
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 430822
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/60077344:_____/07:00087493
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • Leishmania donovani complex; zymodeme; multilocus sequence typing; Leishmania; phylogenetic network (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...odStatuVydavatele
  • AU - Australské společenství
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [4C2DA0A26AD7]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • International Journal for Parasitology
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...v/svazekPeriodika
  • 37
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Horák, Aleš
  • Jirků, Milan
  • Lukeš, Julius
  • Zemanová, Eva
  • Mauricio, I. L.
  • Miles, M. A.
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
issn
  • 0020-7519
number of pages
is http://linked.open...avai/riv/vysledek of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 75 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software