About: Comparative genomics of pathogenic spirochetes of the genus Treponema: the route towards sequence-specific diagnostics

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Comparative genomics of pathogenic spirochetes of the genus Treponema: the route towards sequence-specific diagnostics Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=NI7351
Description	The main aim of this proposal is to compare the genomes of 4 pathogenic a 1 non pathogenic treponeme. The sequence homology will be examined using DNA-microarray based methods. The heterogenic chromosomal regions will be sequenced in non-Nichols strains. Detected differences in the chromosomal sequences will be used for selective PCR diagnostics of the treponemes investigated and the diseases they cause. The recent serological tests do not allow this distinction. (en) Projekt předpokládá vyšetření 4 patogenních a 1 nepatogenního zástupce rodu Treponema. Bude zjišťována sekvenční příbuznost těchto spirochet pomocí techniky DNA-microarray hybridizací a následné sekvenace nehomologních chromosomálních úseků. Zjištěné rozdíly v sekvenci genomové DNA budou použity pro selektivní PCR-DNA diagnostiku chromosomální DNA vyšetřených spirochet a tím i onemocnění, která způsobují. Současné serologické testy tuto diferenciaci neumožňují.
Title	Comparative genomics of pathogenic spirochetes of the genus Treponema: the route towards sequence-specific diagnostics (en) Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice
skos:notation	NI7351
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Infection diseases, microbiology, epidemiology a immunology
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NI7351/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NI7351/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2006-06-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33663341
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	NV - Aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového výzkumu (tzv. %22neprůmyslový výzkum%22)
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Treponema pallidum;DNA microarray;comparative genomics;PCR diagnostics (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Lékařská fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	30 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	30 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMZ02003NI
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Genomes of 3 strains of the genus Treponema (SS14,Samoan D a Cuniculi A) were compared using DNA microarrays, whole genome fingerprinting, and genome sequencing.Observed differences were used for introduction of diagnostic PCR test for syfilis. (en) Byly porovnány genomy 3 kmenů rodu Treponema (SS14,Samoan D a Cuniculi A) pomocí DNA čipů, metody a sekvenace chromosomální DNA. Rozdíly v sekvenci genomů byly využity pro zavedení diagnostického PCR testu na syfilis. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	DNA microarray comparative genomics Treponema pallidum
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Genome differences and detection of pathogenic Treponema pallidum subspecies Transcriptome of Treponema pallidum: gene expression profile during experimental rabbit infection. Comparison of the genomes of pathogenic treponemes, Treponema pallidum ssp. pallidum, ssp. pertenue and Treponema paraluiscuniculi. Restrikční mapování genomů blízce příbuzných spirochet rodu Treponema. Restrikční mapování genomů blízce příbuzných spirochet rodu Treponema. Comparative genomics of pathogenic Treponema pallidum subspecies Functional genomics as a tool to study pathogenic spirochetes Nukleotidové záměny v genomech blízce příbuzných treponem a jejich detekce Nucleotide polytmorphisms in genomes of closely related treponemes and their detection Molekulární detekce a typizace Treponema pallidum subsp. pallidum v klinickém materiálu. Studium domnělých regulátorů genové exprese spirochety Treponema pallidum. Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum. Komparativní genomika Treponema pallidum technikou genomové hybridizace na oligonukleotidovém čipu. Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků Transcriptome of Treponema pallidum: gene expression profile during experimental rabbit infection Comparing genomes of pathogenic and non-pathogenic spirochetes: DNA-microarray hybridizations, whole genome fingerprinting and DNA sequencing. Genomová hybridizace kmenů T. pallidum Nichols a SS14 na oligonukleotidovém čipu Genomics of Treponema. Restrikční mapování genomů blízce příbuzných patogenních spirochet rodu Treponema. Reproducibility of Comparative Genomics Sequencing in Treponema pallidum ssp. pallidum. Comparative genomics of pathogenic Treponema pallidum species Comparative genomics of pathogenic Treponema pallidum subspecies Komparativní genomika patogenních poddruhů Treponema pallidum Transcriptom Treponema pallidum: expresní profilování během experimentální infekce králíků Transcriptome of Treponema pallidum: gene expression profile during experimental rabbit infection Comparative genomics of Treponema pallidum ssp. pallidum and Treponema paraluiscuniculi. Restriction mapping of closely related treponemes Restriction mapping of closely related spirochetes of the genus Treponema Genomic restriction profiles of the selected strains of the genus Treponema Treponema pallidum susp. pallidum v postgenomické éře
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NI7351/2003/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NI7351/2004/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NI7351/2005/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NI7351/2006/orjk%3A14110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software