| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - Diversity of secondary metabolism genes in actinomycetes will be assessed together with 16S rDNA genes diversity in environmental DNA of soils from extremely diverse habitats. Soil samples will be also subjected to the isolation of bacteria. Directed selection of isolates will establish a diversified collection of soil actinomycetes. In the obtained collection of species and strains, diversity of selected secondary metabolic genes coding for common enzymes, e.g. polyketide synthases, or rare ones, e.g. halogenases, will be determined. Phylogenetic trees constructed from sequences of the enzymes typical of secondary metabolism will be compared to those based on the 16S rDNA genes. Presence of the rare genes in the isolates will be correlated to the level of homology in the more common genes. Variability of the rare genes will be studied in relationship to the diversity of sampled habitats but also in relationship to preservation of their original function in the biosynthetic cluster. (en)
- Diverzita genů sekundárního metabolismu společně s diversitou 16S rDNA genů u aktinomycet bude stanovena z půdní DNA odebrané na extrémních stanovištích. Vybrané vzorky půdy budou použity i k izolaci bakterií a vytvoření sbírky zaměřené na neobvyklé a obtížně kultivovatelné skupiny aktinomycet. U souboru sbírkových kmenů bude určována rozmanitost genů kódujících rozšířené enzymy sekundárního metabolismu, např. syntázy polyketidových antibiotik, ale i rozmanitost genů pro vzácně se vyskytující enzymy, např. halogenázy. Evoluční stromy sestavené z těchto enzymů budou porovnávány s fylogenetickými stromy získanými ze sekvencí 16S rDNA. Přítomnost vzácných genů u izolovaných kmenů bude sledována spolu s úrovní homologie u běžnějších genů. Konzervovanost sekvencí vzácných genů bude vztažena k diversitě odběrových míst, ale i k zachování jejich původní funkce v biosyntetickém klastru.
|
| Title
| - Evolution of secondary metabolism in actinomycetes: exploitation of genetic variability (en)
- Evoluce sekundárního metabolismu u aktinomycet: průzkum a využití genetické variability
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - secondary metabolism; antibiotics; Actinomycetales; soil (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - A link from taxonomic to secondary metabolic diversity, and to antimicrobial activity was explored from community scale to individual strains. Data on site specificity of secondary metabolic and related resistance gene pools represent the main output. (en)
- Souvislost mezi taxonomickou a sekundárně metabolickou diversitou a antimikrobiální aktivitou byla zkoumána od společenstev po jednotlivé kmeny. Data o místní specifitě sekundárně metabolických a odpovídajících rezistenčních genů jsou hlavním přínosem. (cs)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - Actinomycetales
- antibiotics
- secondary metabolism
|
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)