About: The efect of methylation and acetylation on chromatin structure

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The efect of methylation and acetylation on chromatin structure Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP202/03/D033
Description	Biochemical modifications of DNA and histones (especially methylation and acetylation) belong to mechanisms of epigenetic regulation which influence chromatin structure with regards to its transcriptional activity/inactivity. Modifications of histones and DNA exist on parallel pathway, however the mutual relationship between individual epigenetic heredity mechanisms are not yet clear. In our experiments the acetylation status of histones on metaphase chromosomes of humid blood cells and methylation status of DNA and histones and will be studied. The effect of hypomethylation and hyperacetylation drugs on the level of methylation/acetylation status of histones and DNA will also be studied. The effect of these biochemical modifications will be evaluated with regards to the higher-order chromatin structure of blood cells. The selected metaphase chromosomes according to the content of CpG islands will be visualised using fluorescence in situ hybridization and indirect immunofluorescence method (en) Biochemické modifikace DNA a histonů (zejména metylace a acetylace) patří mezi epigenetické regulační mechanismy, které ovlivňují strukturu chromatinu vzhledem k jeho transkripční aktivitě/inaktivitě. Zmíněné modifikace histonů a DNA fungují často paralelně, ovšem vzájemné vztahy mezi jednotlivými mechanismy epigenetické dědičnosti, např. vztah mezi acetylací histonů versus metylace DNA, nejsou dosud objasněny. V našich experimentech bude studován metylační stav DNA, histonů a acetylační stav histonů na metafázních chromosomech lidských krevních buněk. Dále bude studován vliv hypometylačního a hyperacetylačního činidla na míru metylace/acetylace histonů a DNA. Vliv těchto biochemických modifikací bude rovněž hodnocen s ohledem na strukturu chromatinu vyššího řádu krevních buněk. Fluorescenční in situ hybridizace a imunofluorescenční metody v kombinaci s cytometrií s vysokým rozlišením umožní vizualizaci vybraných metafázních chromosomů vzhledem k jejich obsahu CpG ostrůvků. V nepřímém
Title	The efect of methylation and acetylation on chromatin structure (en) Vliv metylace a acetylace na strukturu chromatinu
skos:notation	GP202/03/D033
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP202%2F03%2FD033/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP202%2F03%2FD033/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-10-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	2497897
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Fakulta informatiky
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2006
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2007
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02003GA2PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace EA - Morfologické obory a cytologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byly studovány metylační statusy metafázních chromozómů, zejména u chromozómu 2 (HSA 2) v nádorových retinoblastomových buňkách Y79 a v leukemických buňkách K-562. Byly zjištěny odlišné metylační statusy na chromozómu 2 u těchto dvou typů buněk. Cílem na (cs) The DNA methylation states of metaphase chromosomes were studied especially on the chromosome 2 in malignantretinoblastome cell line Y79 and in leukemic celIs K-562. We have observed differences between methylation states ofchromosome 2 in the two ty (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Cytological study of DNA methylation and histone methylation patterns in human cell lines Distinct patterns of histone methylation and acetylation in human interphase nuclei Automatic Detection of Histones on Chromosome X in Images of Cell Nuclei Relationship of HP1 proteins to centromeric heterochromatin characterized by the presence of H3(K9) and absence of H3(K4) dimethylation Relationship of HP1 proteins centromeric heterochromatin characterized by the presence of H3(K9) and absence of H3(K4) dimethylation Nuclear levels and patterns of histone H3 modification and HP1 proteins after inhibition of histone deacetylases
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP202%2F03%2FD033/2003/orjk%3A14330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP202%2F03%2FD033/2004/orjk%3A14330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP202%2F03%2FD033/2005/orjk%3A14330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP202%2F03%2FD033/2006/orjk%3A14330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP202%2F03%2FD033/2007/orjk%3A14330

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 80 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software