About: Functional genomics of the complement-like molecules in the tick Ixodes ricinus

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Functional genomics of the complement-like molecules in the tick Ixodes ricinus Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP506/10/2136
Description	Current release of the tick Ixodes scapularis genome and feasibility of RNA interference (RNAi) promote ticks to become a full-value model for deeper studies of tick immune system and its interaction with transmitted pathogens. Previously, we have characterized tick alpha2-macroglobulins (a2M) and fibrinogen-related lectins playing an important role in invertebrate immunity. Data mining from I. scapularis genome further revealed 9 proteins related to a2M, C3 complement component, insect thioester proteins and a homolog of C2/factor B. Given the close similarity of the European tick Ixodes ricinus, we can perform a reasonable functional genomics study based on RNAi silencing of tick complement-like molecules linked with reliable phagocytic assay of model pathogen Chryseobacterium indologenes by tick hemocytes. These experiments will disclose which molecules are involved and how they are organized in an ancient complement-like pathway. The cellular immune response will be tested also against other bacteria including the Lyme disease spirochetes. (en) Současné zveřejnění genomu klíštěte Ixodes scapularis a možnost použití RNA interference (RNAi) umožňuje, aby se klíšťata stala plnohodnotným modelem pro detailní zkoumání interakce jejich imunitního systému s přenášenými patogeny. Již dříve jsme charakterizovali klíštěcí alfa2-makroglobuliny a fibrinogenu-podobné lektiny, které hrají důležitou úlohu v imunitě bezobratlých. Hledáním v genomu I. scapularis jsme dále nalezli 9 dalších proteinů příbuzných a2M, C3 složce komplementu, hmyzím thioesterovým proteinům a homolog složky C2/ faktoru B. Díky blízké příbuznosti evropského klíštěte Ixodes ricinus můžeme provést relevantní funkčně genomickou studii založenou na RNAi umlčení komplementu-podobných molekul ve spojení se spolehlivým testem fagocytózy modelového patogena Chryseobacterium indologenes klíštěcími hemocyty. Tyto experimenty odhalí zúčastněné molekuly a jejich funkci v primitvní dráze podobné komplementu. Tato buněčná imunitní odpověď bude studována i proti dalším bakteriím včetně spirochet Lymské boreliózy.
Title	Functional genomics of the complement-like molecules in the tick Ixodes ricinus (en) Funkční genomika molekul podobných komplementu u klíštěte Ixodes ricinus
skos:notation	GAP506/10/2136
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP506%2F10%2F2136/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP506%2F10%2F2136/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-01-30 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	92535500
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EC - Imunologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	tick; Ixodes; Borrelia; complement; phagocytosis (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2012-03-30 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P506%2F10%2F2136
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2012
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2013
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02010GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2012-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie ED - Fyziologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Excellent results characterize poorly known factors of the tick immune system (thioester-containing proteins, peptidase inhibitors, convertases; primitive complement cascade, RNAi-proved function of selected proteins in hemocytes, etc.). These data can substantially influence our understanding of pathogen transmission via ticks. Outputs: 3 papers in international journals and several manuscripts. (en) Vynikající výsledky ukazují na dosud málo známé faktory imunitního systému klíšťat (průkaz thioesterových proteinů, inhibitorů peptidáz, konvertáz; fungování primitivní komplementové kaskády, testování funkce proteinů v hemocytech pomocí RNAi, atd.). Poznatky mohou mít zásadní význam pro pochopení přenosu patogenů. Výstupem jsou 3 impaktované publikace a několik dalších v přípravě. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	tick Borrelia Ixodes complement
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Interaction of the tick immune system with transmitted pathogens Functional genomics of tick thioester-containing proteins reveal the ancient origin of the complement system IrFC - An Ixodes ricinus injury-responsive molecule related to Limulus Factor C Thioester-containing proteins of the tick Ixodes ricinus: Gene expression, response to microbial challenge and their role in phagocytosis of the yeast Candida albicans Tick as a Model for the Study of a Primitive Complement System Tick Innate Immunity.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F10%2F2136/2010/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F10%2F2136/2011/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F10%2F2136/2012/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F10%2F2136/2013/ico%3A60077344

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 25 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software