| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - A large number of nitrilases were sequenced, but only a small part of them were examined for enzymatic function. The expression of about 25 synthetic genes coding for hypothetical nitrilases in fungi (primarily phytopathogenic species) and biochemical examination of the translation products will allow us to describe for the first time the function of these enzymes. We shall classify them into subgroups of differing substrate specificities and, on the basis of kinetic data, formulate hypotheses on the natural substrates of fungal nitrilases. Selected nitrilases differing in substrate specificities will be purified and characterized in terms of their catalytic and structural properties . We shall also express (in E. coli and Rhodococcus sp.) about five nitrilases from actinobacteria and compare their substrate specificity and structural properties with those of fungal nitrilases. We shall evaluate the ability of fungal and bacterial nitrilases to transform benzonitrile herbicides and propose microorganisms and enzymes suitable for elimination of these compounds. Expression of a representative set of nitrilase genes will allow us to conclude if the effect of chaperones on the production of functional nitrilases is general among nitrilases or case specific. (en)
- Pouze malá část ze sekvenovaných nitrilas byla zkoumána z hlediska enzymové funkce. Exprese asi 25 syntetických genů kódujících hypotetické nitrilasy v houbách (hlavně fytopatogenních druzích) a biochemická charakterizace produktů jejich translace nám umožní poprvé popsat funkci těchto enzymů. Roztřídíme je do skupin podle substrátové specifity a na základě kinetických dat budeme formulovat hypotézy o jejich přirozených substrátech. Vybrané nitrilasy lišící se v substrátové specifitě budou purifikovány a charakterizovány, pokud jde o jejich katalytické a strukturální vlastnosti. Budeme také exprimovat (v E. coli and Rhodococcus sp.) kolem pěti nitrilas z aktinobakterií a srovnáme jejich substrátovou specifitu a strukturální vlastnosti s fungálními nitrilasami. Vyhodnotíme schopnost fungálních a bakteriálních nitrilas transformovat benzonitrilové herbicidy a navrhneme mikroorganismy a enzymy vhodné k eliminaci těchto látek. Exprese reprezentativního souboru nitrilasových genů nám umožní vyhodnotit vliv chaperonů na expresi nitrilas a zjistit, zda se jedná o jev obecný nebo specifický pro určité enzymy.
|
| Title
| - Interspecies comparison of nitrilases by using recombinant enzymes obtained by database-mining: their environmental impact and potential application (en)
- Mezidruhová analýza rekombinantních nitrilas exprimovaných z hypotetických sekvencí, jejich význam a potenciální aplikace v životním prostředí
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - nitrilase phytopathogenic fungi actinobacteria heterologous expression chaperone co-expression substrate specificity purification and characterization benzonitrile herbicide biodegradation (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - 1. Created set of new nitrilasez were created, optimization of their production, new finding about their distribution in natural conditions. 2. Data given in report are appropriate. 3. results important in science, applied environmental research, education. 4. Publication output very good. 5. No imperfections found. (en)
- 1. Byla vytvořena knihovna nitriláz, optimalizována jejich produkce a objasněna jejich distribuce v přírodě. 2. Údaje řešitelky jsou adekvátní. 3. Výsledky použitelné v molekulární ekologii, environmentálních vědách, mikrobiologii. Podíl studentů na řešení projektu a možnost přímo implementovat výsledky do výuky. 4. Publikační výstupy jsou velice dobré. 5. Nedostatky nebyly shledány. (cs)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)