About: Mapping of the colicin route to the sensitive and immune bacterium: studies on colicin-receptor and colicin-immunity protein interaction

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Mapping of the colicin route to the sensitive and immune bacterium: studies on colicin-receptor and colicin-immunity protein interaction Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA310/03/1091
Description	Colicins are exocellular bacterial protein toxins produced by some bacterial strains of the family Enterobacteriaceae. Their highly efficient ability to kill sensitive bacteria is facilitated by highly specific interactions between colicin molecule andthe cell envelope proteins (and other components) of sensitive bacterium. Although colicins have been extensively studied in the past decades, little is known about the colicin recognition of outer membrane receptor and inhibition of colicin killingactivity by their cognate immunity proteins synthesized by producer bacteria. Here we propose to characterize the colicin-receptor and colicin-immunity protein interactions. We propose to use colicin U and OmpA protein as a model for colicin-receptorinteractions because of the significant advantages of this study system. The residues of OmpA protein involved in colicin U binding will be identified and the binding assays will be used to differentiate between binding and the ability to mediate the (en) Koliciny jsou toxické exoproteiny produkované některými kmeny čeledi Enterobacteriaceae. Vysoce specifické interakce kolicinového proteinu s komponentami bakteriálního obalu podmiňují vysokou (téměř absolutní) letální účinnost a specifitu těchto molekul.Snadná detegovatelnost kolicinového účinku na citlivé bakterie předurčuje kolicinový výzkum jako modelový pro studium interakce proteinů s komponenty bakteriální buňky. Navrhujeme studovat interakci kolicinu U s receptorovým proteinem OmpA. OmpA receptormá oproti jiným proteinům zevní membrány řadu výhod: jeho krystalová struktura je známa, je přítomen v monomerní formě, 170 N-terminálních aminokyselinových zbytků kóduje transmembránovou část proteinu a mutantní OmpA proteiny s delecí každé ze čtyřindividuálních extracelulárních kliček byly zkonstruovány. Cílem projektu je identifikace aminokyselinových zbytků OmpA proteinu a kolicinu U, které spolu navzájem interagují a definice vazebných epitopů. Dále navrhujeme studovat interakci imunitního
Title	Mapping of the colicin route to the sensitive and immune bacterium: studies on colicin-receptor and colicin-immunity protein interaction (en) Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem
skos:notation	GA310/03/1091
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA310%2F03%2F1091/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA310%2F03%2F1091/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2009-01-15 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33436151
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Lékařská fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	17 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	17 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02003GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byla zmapována interakční místa v proteinu OmpA, kolicinů U a Y a na imunitních proteinech kolicinů U a Y.Byly identifikovány 3 aminokyselinové zbytky v proteinu OmpA, které interagují s kolicinem U. Vedle I45 je dalším zásadním aminokyselinovým zbytkem, (cs) Interaction sites of OmpA protein, colicins U and Y and their cognate immunity proteins (Cui and Cyi, respectively) were mapped.Three amino acid residues that interact with colicin U molecule were identified in the receptor protein OmpA: I45 (localized i (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny Hybrid colicin molecules U/Y and their interaction with immunity proteins Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny Molekulární interakce kolicinu U se svým imunitním proteinem. Molekulární interakce kolicinu U se svým imunitním proteinem. Phage tail-like (high molecular weight) bacteriocins of Budvicia aquatica and Pragia fontium (Enterobacteriaceae). Interakce kolicinů U a Y s rekombinantními imunitními proteiny Exoproducts of the strain Escherichia coli H22 inhibiting some enteric pathogens both in vitro and in vivo. Recognition of pore-forming colicin Y by its cognate immunity protein. Incidence of lysogenic, colicinogenic and siderophore producer strains among human saprophytic Escherichia coli. Occurence of strains producing specific anti-bacterial inhibitory agents in five genera of Enterobacteriaceae. Molekulární interakce kolicinu se svým imunitním proteinem. Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny. Molecular recognition of colicin U and Y pore-forming domains by their cognate immunity proteins. Hybrid colicin U/Y molecules and their interaction with immunity proteins Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem Ten new temperate bacteriophages of Citrobacter youngae.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA310%2F03%2F1091/2003/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA310%2F03%2F1091/2004/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA310%2F03%2F1091/2005/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA310%2F03%2F1091/2006/orjk%3A14110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software