About: Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Koliciny jsou antibakteriální proteiny, jejichž geny jsou lokalizovány na plazmidech a jsou produkovány bakteriálními kmeny z čeledi Enterobacteriaceae (zejména druhem Escherichia coli). Toxický účinek (tvorba iontových kanálů v plazmatické membráně) je zajišťován C-koncovou doménou a je omezen na citlivé kmeny druhů stejných nebo příbuzných kmenu produkčnímu. Syntézou imunitního proteinu, jehož gen je součástí kolicinogenního plazmidu, se producenti brání letálnímu efektu syntetizovaného kolicinu. Interakce mezi rozpustným kolicinem a membránově vázaným imunitním proteinem je vhodným modelem pro studium protein-proteinových interakcí. Vybrali jsme si dvojici kolicinů U a Y, mezi nimiž je 87% totožnost na úrovni aminokyselinové sekvence a přesto jejich producenti nejsou navzájem zkříženě imunní. Mutovali jsme aminokyseliny kolicinu U (Y) ve smyslu sekvence kolicinu Y (U), sledovali změny v interakci mutovaných kolicinů s imunitním proteinem a určili interakční aminokyseliny kolicinu U a Y.
  • Koliciny jsou antibakteriální proteiny, jejichž geny jsou lokalizovány na plazmidech a jsou produkovány bakteriálními kmeny z čeledi Enterobacteriaceae (zejména druhem Escherichia coli). Toxický účinek (tvorba iontových kanálů v plazmatické membráně) je zajišťován C-koncovou doménou a je omezen na citlivé kmeny druhů stejných nebo příbuzných kmenu produkčnímu. Syntézou imunitního proteinu, jehož gen je součástí kolicinogenního plazmidu, se producenti brání letálnímu efektu syntetizovaného kolicinu. Interakce mezi rozpustným kolicinem a membránově vázaným imunitním proteinem je vhodným modelem pro studium protein-proteinových interakcí. Vybrali jsme si dvojici kolicinů U a Y, mezi nimiž je 87% totožnost na úrovni aminokyselinové sekvence a přesto jejich producenti nejsou navzájem zkříženě imunní. Mutovali jsme aminokyseliny kolicinu U (Y) ve smyslu sekvence kolicinu Y (U), sledovali změny v interakci mutovaných kolicinů s imunitním proteinem a určili interakční aminokyseliny kolicinu U a Y. (cs)
  • Colicins are antibacterial toxins produced by strains of Escherichia coli and related bacteria that provide a selective advantage against closely related strains in the competition among bacteria. Toxic effect that is mediated by the C-terminal domain is depolarization of the cytoplasmic membrane of sensitive cells. The plasmid encoded immunity protein ensures that producers are protected against the effect of their own colicin. The recognition of soluble colicin by the membrane-bounded immunity protein is a suitable model for studying protein-protein interactions. The pair of colicins U and Y had 87% identity in their pore-forming domains but the corresponding producers were not cross-immune. The amino acids of colicin U (Y) were mutated into those appearing in the sequence of colicin Y (U) and changes in the interactions between mutated colicins and immunity proteins were monitored and interactions sites were identified. (en)
Title
  • Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.
  • Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny. (cs)
  • Molecular recognition of colicin U and Y by their immunity proteins (en)
skos:prefLabel
  • Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny.
  • Molekulární rozpoznávání kolicinů U a Y svými imunitními proteiny. (cs)
  • Molecular recognition of colicin U and Y by their immunity proteins (en)
skos:notation
  • RIV/00216224:14110/05:00013197!RIV10-GA0-14110___
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(GA310/03/1091), Z(MSM0021622415)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 531049
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/00216224:14110/05:00013197
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • colicin U; colicin Y; immunity protein (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [0FB4F6D555CB]
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Šmajs, David
  • Janalíková, Magda
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 14110
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software