About: Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	skos:Concept http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek
Description	Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Plazmidy nesoucí tyto geny byly transformovány do E. coli a z těchto buněk byly následně izolovány hybridní koliciny. Zkoumali jsme jejich letální účinek na buňky transformované plazmidem nesoucí gen pro imunitní protein kolicinu U a kolicinu Y. Buňky bez imunitního proteinu sloužily jako kontrola. Zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolici Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Plazmidy nesoucí tyto geny byly transformovány do E. coli a z těchto buněk byly následně izolovány hybridní koliciny. Zkoumali jsme jejich letální účinek na buňky transformované plazmidem nesoucí gen pro imunitní protein kolicinu U a kolicinu Y. Buňky bez imunitního proteinu sloužily jako kontrola. Zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolici (cs) Interaction of colicins with their cognate immunity proteins has been studied. Amino acid residues V590 a Y586 were found to be important for interaction of colicin Y with its cognate immunity protein and G580 and F576 in the colicin U molecule. (en)
Title	Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny (cs) Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins (en)
skos:prefLabel	Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny (cs) Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins (en)
skos:notation	RIV/00216224:14110/04:00012096!RIV08-GA0-14110___
http://linked.open.../vavai/riv/strany	11-12
http://linked.open...avai/riv/aktivita	P
http://linked.open...avai/riv/aktivity	P(GA310/03/1091)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat	2008
http://linked.open...aciTvurceVysledku	Šmajs, David Doležalová, Magda
http://linked.open.../riv/druhVysledku	D - Článek ve sborníku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open...titaPredkladatele	Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
http://linked.open...dnocenehoVysledku	566909
http://linked.open...ai/riv/idVysledku	RIV/00216224:14110/04:00012096
http://linked.open...riv/jazykVysledku	cze - čeština
http://linked.open.../riv/klicovaSlova	colicin; immunity protein (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo	colicin immunity protein
http://linked.open...ontrolniKodProRIV	[E6A0CC23E083]
http://linked.open...v/mistoKonaniAkce	Brno
http://linked.open...i/riv/mistoVydani	Brno
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje	VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004.
http://linked.open...in/vavai/riv/obor	EE
http://linked.open...ichTvurcuVysledku	2 (xsd:int)
http://linked.open...cetTvurcuVysledku	2 (xsd:int)
http://linked.open...vavai/riv/projekt	Mapping of the colicin route to the sensitive and immune bacterium: studies on colicin-receptor and colicin-immunity protein interaction
http://linked.open...UplatneniVysledku	2004
http://linked.open...iv/tvurceVysledku	Šmajs, David Janalíková, Magda
http://linked.open...vavai/riv/typAkce	CST - Celostátní
http://linked.open.../riv/zahajeniAkce	2004-01-01 (xsd:date)
number of pages	2 (xsd:int)
http://purl.org/ne...btex#hasPublisher	Masarykova univerzita v Brně
https://schema.org/isbn	80-210-3321-5
http://localhost/t...ganizacniJednotka	14110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 91 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software