About: Characterization of novel host cell protein interacting with protease of Mason-Pfizer monkey virus

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Characterization of novel host cell protein interacting with protease of Mason-Pfizer monkey virus Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA204/09/1388
Description	The aim of this proposal is to characterize the interaction of Mason-Pfizer monkey virus protease (PR) with protein of unknown cellular function, which was identified by yeast two hybrid system and named PRotease Interacting Protein (PRIP). The interaction of both proteins in cells co-transfected with genes for both proteins will be confirmed by co-immunoprecipitation of PRIP with PR, by verification of their intracellular co-localization by confocal microscopy and pull-down assay. Direct proof of the interaction will be performed by titration of labeled PR with PRIP using NMR spectroscopy. PRIP will be characterized and its role in the cell will be studied by evaluation of changes of expression profiles induced by down-regulation of PRIP expression using siRNA. Microarrays and evaluation of biochemical and morphological characteristic will be performed. The project should shed some light on the function of PRIP in the cell and answer the question about the significance of its interaction with PR for virus life cycle. (en) Předmětem grantové aplikace je charakterizace interakce proteasy (PR) Mason-Pfizerova opičího viru s buněčným proteinem, jehož vazba k PR byla identifikována pomocí dvojhybridního kvasinkového systému. Tento protein, jehož buněčná funkce není známa byl nazván PRIP (PRotease Interacting Protein). Vzájemná interakce v buňkách transfekovaných geny pro oba proteiny bude potvrzena koimunoprecipitací PRIP s PR, ověřením jejich kolokalizace v buňkách a „pull-down“ metodou. Studiem interakce delečních mutantů a peptidů budou charakterizovány oblasti obou proteinů zodpovědné za vzájemnou interakci. Pro přímý důkaz vzájemné interakce bude využita titrace značené PR pomocí PRIP sledovaná NMR spektroskopií. PRIP bude biochemicky charakterizován a jeho role v buňkách bude studována vyhodnocením změn vyvolaných potlačením jeho syntézy pomocí siRNA. Budou porovnány jak expresní profily normálních a umlčených buněk pomocí mikročipů, tak jejich biochemické a morfologické rysy. Výsledkem projektu by tedy měla být informace o roli PRIP v buňce a významu jeho interakce s PR pro životní cyklus viru.
Title	Characterization of novel host cell protein interacting with protease of Mason-Pfizer monkey virus (en) Charakterizace nového buněčného proteinu interagujícího s proteasou Mason-Pfizerova opičího viru
skos:notation	GA204/09/1388
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F09%2F1388/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F09%2F1388/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-07-01 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100269271
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	retrovirus protease interaction infection M-PMV HIV (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-06-12 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/204-09-1388
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2013
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02009GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2013-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2009-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Projekt byl úspěšný. Významné jsou strukturní určení jedné z domén kapsidového proteinu M-PMV NMR spektroskopií a nezralé retrovirové částice elektronovou mikroskopií. Výsledky dosažené v průběhu řešení grantu vedly k šesti publikacím ve velmi dobrých časopisech (jedna v Nature) a jednomu českému patentu, který je využíván firmou Generi Biotech. Dvě publikace jsou v recenzním řízení. (cs) Project was successful. Important are structural characterizations of one domain of capsid protein of M-PMV by NMR spectroscopy and of immature retroviral capsid by electron microscopy. Results achieved during grant solution led to six papers in good journals (one in Nature) and one Czech patent employed by company Generi Biotech. Two papers are being reviewed. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Method of testing inhibitors of virus particle formation in large extent by making use of labeled oligonucleotides or nucleic acids The effect of dimerizing domains and basic residues on in vitro and in vivo assembly of Mason-Pfizer monkey virus and Human immunodeficiency virus NMR Structure of the N-Terminal Domain of Capsid Protein from the Mason-Pfizer Monkey Virus The G-Patch Domain of Mason-Pfizer Monkey Virus Is a Part of Reverse Transcriptase In Vitro Assembly of Virus-Like Particles of a Gammaretrovirus, the Murine Leukemia Virus XMRV Breast cancer-associated protein - a novel binding partner of Mason-Pfizer monkey virus protease Structure of the immature retroviral capsid at 8 angstrom resolution by cryo-electron microscopy One-step separation of myristoylated and nonmyristoylated retroviral matrix proteins HIV-1 protease-induced apoptosis
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F09%2F1388/2009/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F09%2F1388/2010/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F09%2F1388/2011/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F09%2F1388/2012/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F09%2F1388/2013/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F09%2F1388/2014/ico%3A61388963

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software