About: Application of MALDI-TOF (matrix assisted laser desorption ionisation - Time of Flight) mass spectrometry on the determination of protein conformation

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Application of MALDI-TOF (matrix assisted laser desorption ionisation - Time of Flight) mass spectrometry on the determination of protein conformation Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/02/0922
Description	In the course of this year (2001) we have purchased a mass spectrometer working on MALDI-TOF principle (Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation - Time Of Flight). The aim of this project is to construct a panel of methods allowing the application of this method on the study of proteins' conformation. For several decades a number of methods has been known that allow to modify covalently reactive groups localised on the surface of protein molecules (amino groups, side chains of Tyr, Trp, His, Cys etc.) under non-denaturing conditions. After the modification and cleavage of the protein by trypsin (or some other standard method), surface reactive groups should be identified by mass spectrometry. Bifunctional reagents can also be used that connect two reactive groups; their relative distance can be determined with certain accuracy. This methodology can be employed for any globular protein in solution; we are going to use it together with traditional spectroscopic methods for the study of an (en) V tomto roce (2001) jsme zakoupili hmotnostní spektrometr pracující na principu MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation - Time Of Flight). Cílem tohoto projektu je vybudovat panel standardních metod umožňujících využít tohoto zařízení ke studiu konformace bílkovin. Již několik desetiletí jsou známy metody, umožňující za nedenaturujících podmínek kovalentně modifikovat reaktivní skupiny na povrchu bílkovinných molekul (aminoskupiny, postranní řetězce Tyr, Trp, His, Cys atd). Po modifikacia rozštěpení bílkoviny trypsinem (či jiným standardním specifickým postupem) bychom měli být pomocí hmotnostní spektrometrie schopni jednoznačně identifikovat povrchové reaktivní skupiny proteinu. Nabízí se i možnost využít bifunkční činidla, která mohoupropojit dvě reaktivní skupiny a určit tak, s jistou přesností, jejich relativní vzdálenost. Tato metodika by měla být použitelná pro libovolnou globulární bílkovinu v roztoku; na našem pracovišti ji použijeme, v kombinaci s klasickými spektrálními
Title	Application of MALDI-TOF (matrix assisted laser desorption ionisation - Time of Flight) mass spectrometry on the determination of protein conformation (en) Studium konformace bílkovin pomocí hmotnostní spektrometrie na principu MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation - Time Of Flight)
skos:notation	GA203/02/0922
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F02%2F0922/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F02%2F0922/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2008-06-02 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	1564645
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Fakulta potravinářské a biochemické technologie
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2004
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2002
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2005
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2005
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02002GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byly zavedeny metody, umožňující specificky modifikovat postranní řetězce některých aminokyselin (lysin, tryptofan, tyrosin) a tyto modifikace identifikovat pomocí hmotnostní spektrometrie.Analysou výsledků modifikací modelových proteinů o známé prostoro (cs) Application of MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation - Time Of Flight) mass spectrometry in the determination of protein conformation There were introduced techniques that allow to modify specifically the side chains of several amino-aci (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Citraconylation - a simple method for high protein sequence coverage in MALDI-TOF mass spectrometry Is It Possible to Study Conformation of an Unpurified Protein? Tryptophan modification by 2-hydroxy-5-nitrobenzyl bromide studied by MALDI-TOF mass spectrometry Tryptophan modification by 2-hydroxy-5-nitrobenzyl bromide studied by MALDI-TOF mass spectrometry. Analysis of tryptophan surface accessibility by MALDI-TOF mass spectrometry Analysis of tryptophan surface accessibility in proteins by MALDI-TOF mass spectrometry Tyrosine residues modification studied by maldi-tof mass spectrometry Tyrosine residues modification studied by MALDI-TOF mass spectrometry Tyrosine Residues Modifications Studied by MALDI-TOF MS
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0922/2002/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0922/2003/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0922/2004/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0922/2005/orjk%3A22330

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software