About: Epigenetic regulation of gene expression in transgenic and endogenous loci of higher plants

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Epigenetic regulation of gene expression in transgenic and endogenous loci of higher plants Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA521/04/0775
Description	Plant transgenes often display variable, often unpredictable expression caused by epigenetic modifications of transgenic DNA (T-DNA). Transgene instability can potentially hamper application of transgenic technology in agriculture and biotechnology. Therefore this project focuses on the analysis of epigenetic stability of plant transgenes. Association between epigenetic modification of cytosine residues in DNA and gene silencing has been described in both mammals and plants. We propose to carry out a detailed investigation of our initial observation of methylation spreading in posttranscriptionally silenced transgenic loci of Nicotiana tabacum that occured in cell culture. Several novel epiallalelic variants of the transgene silencer locus will be analysed for gene expression of the reporter gene, type of silencing and in trans silencing capacities. Evolutionary consequences of spreading phenomenon will be assessed by following mitotic and meiotic transmission of different methylation features. (en) Rostlinné transgeny často oproti teoretickým předpokladům vykazují sníženou expresi v důsledku epigenetických modifikací (například metylace DNA), což negativně ovlivňuje aplikaci geneticky modifikovaných rostlin v zemědělství a biotechnologiích. Asociace mezi metylační modifikací DNA a umlčováním genové exprese byla ověřená na mnoha živočišných i rostlinných modelech. V předkládaném projektu navrhujeme provést hlubší analýzu našeho původního pozorování - šíření metylace DNA v posttranskripčně umlčeném transgenním lokusu Nicotiana tabacum v průběhu kulivace buněk in vitro. Na modelových transgenních liniích budou zkoumány vývojové, genetické a evoluční aspekty tohoto fenoménu. Bude sledován vliv epigenetických modifikací na expresi reporterového genu pro bakteriální neomycinfosfotransferázu. Linie obsahující epimutované alely transgenu budou dále podrobeny analýze z hlediska schopnosti induktoru umlčovat expresi homologního lokusu in trans. Budou hledány paralely v epigenetickém
Title	Epigenetic regulation of gene expression in transgenic and endogenous loci of higher plants (en) Epigenetická regulace genové exprese v transgenních a endogenních lokusech vyšších rostlin
skos:notation	GA521/04/0775
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA521%2F04%2F0775/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA521%2F04%2F0775/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-10-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	2323803
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	11 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	11 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2006
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2004
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2007
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02004GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EI - Biotechnologie a bionika GE - Šlechtění rostlin
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Je známo, že transgenní lokusy mohou v buněčném jádře interagovat jak mezi sebou tak i s geny hostitelského organismu. Náš výzkum založený na kombinaci klasického Mendelova křížení rostlin a moderních metod molekulární biologie přinesl poznatek, že pouze (cs) In the nucleus, transgene loci may interact with each other and as well as with endogenous genes of a host organism. As a result of these interactions there is a hardly predictable expression of genetic traits critical for application of transgene techno (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Rapid concerted evolution of nuclear ribosomal DNA in two tragopogon allopolyploids of recent and recurrent origin Preferential elimination of repeated DNA sequences from the paternal, Nicotiana tomentosiformis genome donor of a synthetic, allotetraploid tobacco Molecular cytogenetics and tandem repeat sequence evolution in the allopolyploid Nicotiana rustica compared with diploid progenitors N. paniculata and N. undulata Dynamic changes in the distribution of a satellite homologous to intergenic 26-18S rDNA spacer in the evolution of Nicotiana The trans-silencing capacity of invertedly repeated transgenes depends on their epigenetic state in tobacco Plant 5S rDNA has multiple alternative nucleosome positions Comparative genomics and repetitive sequence divergence in the species of diploid Nicotiana section Alatae Efficacy of DNA hypomethylating capacities of 5-aza-2'-deoxycytidine and its alpha anomer Sequence of events leading to near-complete genome turnover in allopolyploid Nicotiana within five million years Plant highly repeated satellite DNA: molecular evolution, distribution and use for identification of hybrids Long-term genome diploidization in allopolyploid Nicotiana section Repandae (Solanaceae)
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F04%2F0775/2007/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F04%2F0775/2004/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F04%2F0775/2005/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F04%2F0775/2006/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software