About: Utilization of immobilized lysozyme for identification of bacterial proteins by mass spectrometry     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Cílem této práce bylo připravit účinný nosič s imobilizovaným enzymem lysozymem pro efektivní narušení buněčné stěny G+ bakterií a získat tak materiál pro rychlou a reprodukovatelnou analýzu bakteriálního proteomu hmotnostní spektrometrií. Bylo nutné vytipovat a zavést jednoduchou metodu pro stanovení aktivity enzymu lysozymu a následně připravit nosič, kde bude enzym kovalentně vázán tak, aby jeho aktivita a stabilita byla zachována i během opakovaného použití. Pro naše účely se osvědčila citlivá spektrofluorimetrická metoda pomocí 4-methylumbelliferyl-beta-D-N,N',N''-triacetylchito-triosidu. Lysozym byl imobilizován na magnetické částice s různými funkčními skupinami, velikostí částic i porozitou. Na základě výsledků byl vybrán nejvhodnější nosič, u kterého byla stanovena skladovací a operační stabilita. Vázaná i volná forma enzymu byly poté použity k přípravě vzorků G+bakterií určených k MALDI-TOF-MS identifikaci a výsledky byly porovnány s tradiční přípravou bakteriálních vzorků pro MS analýzu.
  • Cílem této práce bylo připravit účinný nosič s imobilizovaným enzymem lysozymem pro efektivní narušení buněčné stěny G+ bakterií a získat tak materiál pro rychlou a reprodukovatelnou analýzu bakteriálního proteomu hmotnostní spektrometrií. Bylo nutné vytipovat a zavést jednoduchou metodu pro stanovení aktivity enzymu lysozymu a následně připravit nosič, kde bude enzym kovalentně vázán tak, aby jeho aktivita a stabilita byla zachována i během opakovaného použití. Pro naše účely se osvědčila citlivá spektrofluorimetrická metoda pomocí 4-methylumbelliferyl-beta-D-N,N',N''-triacetylchito-triosidu. Lysozym byl imobilizován na magnetické částice s různými funkčními skupinami, velikostí částic i porozitou. Na základě výsledků byl vybrán nejvhodnější nosič, u kterého byla stanovena skladovací a operační stabilita. Vázaná i volná forma enzymu byly poté použity k přípravě vzorků G+bakterií určených k MALDI-TOF-MS identifikaci a výsledky byly porovnány s tradiční přípravou bakteriálních vzorků pro MS analýzu. (cs)
  • The goal of this study was to develop an active carrier with immobilized enzyme lysozyme for effective disruption of G+ bacteria cell wall and obtain material for rapid and reproducible analysis of bacterial proteome by MS. Efficient method for determination of Lysozyme activity has been estimated and followed by immobilization of enzyme to the magnetic carrier. Final activity, stability and reaction conditions of immobilized enzyme were estimated. Spectrofluorimetric measurement of lysozyme activity with 4-methylumbelliferyl-beta-D-N,N',N''-triacetylchitotrioside was found to be the most beneficial. To find the best active system the lysozyme was immobilized to the magnetic particles with different functional groups, size and porosity. The most convenient carrier with immobilized lysozyme has been selected, in which the storage and operational stability were determined. The results of total proteome analysis by MALDI-TOF-MS were compared with results obtained by traditional preanalytical approach. (en)
Title
  • Utilization of immobilized lysozyme for identification of bacterial proteins by mass spectrometry (en)
  • VYUŽITÍ IMOBILIZOVANÉHO LYSOZYMU PRO IDENTIFIKACI BAKTERIÁLNÍCH PROTEINŮ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIÍ
  • VYUŽITÍ IMOBILIZOVANÉHO LYSOZYMU PRO IDENTIFIKACI BAKTERIÁLNÍCH PROTEINŮ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIÍ (cs)
skos:prefLabel
  • Utilization of immobilized lysozyme for identification of bacterial proteins by mass spectrometry (en)
  • VYUŽITÍ IMOBILIZOVANÉHO LYSOZYMU PRO IDENTIFIKACI BAKTERIÁLNÍCH PROTEINŮ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIÍ
  • VYUŽITÍ IMOBILIZOVANÉHO LYSOZYMU PRO IDENTIFIKACI BAKTERIÁLNÍCH PROTEINŮ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIÍ (cs)
skos:notation
  • RIV/00216275:25310/11:39881877!RIV12-GA0-25310___
http://linked.open...avai/predkladatel
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(GA203/09/0857), S, Z(MSM0021627502)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 240523
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/00216275:25310/11:39881877
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • Mass spectrometry; Bacterial proteins; Magnetic microparticles; Lysozyme (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [313AA1BC90C0]
http://linked.open...v/mistoKonaniAkce
  • Luka nad Jihlavou
http://linked.open...i/riv/mistoVydani
  • Pardubice
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • Sborník příspěvků ze semináře Monitorování cizorodých látek v životním prostredí XIII.
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Hubálek, Martin
  • Roušar, Tomáš
  • Bílková, Zuzana
  • Korecká, Lucie
  • Holubová, Lucie
http://linked.open...vavai/riv/typAkce
http://linked.open.../riv/zahajeniAkce
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
number of pages
http://purl.org/ne...btex#hasPublisher
  • Univerzita Pardubice
https://schema.org/isbn
  • 978-80-7395-450-5
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 25310
is http://linked.open...avai/riv/vysledek of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software