About: Identification and biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Identification and biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=MEB061003
Description	Downy and powdery mildews are obligate biotrophic plants pathogens causing severe diseases in economically important crops. Their diagnostics is currently based on a combination of host specificity, symptoms and microscopy. Although the relevance of phenotypic characters has been discussed, microscopic investigation still remains indispensable. However, this method depends strongly on systematic practice and experience of a plant pathologist. We suggest to develop an alternative approach based on mass spectrometry, which requires only very small amount of biological material and sample processing and data interpretation are fast and relatively easy. Database searches with comparing typical and unknown mass spectra then allow identification and taxonomical classification of microorganisms for example by principle component analysis. A majority of planned experiments will rely on mass spectrometric analyses of surface proteins released by an acidic treatment of the plant pathogens. In the frame of this (en) Plísně jsou obligátními biotrofními patogeny rostlin, které způsobují vážná onemocnění ekonomicky důležitých plodin. Jejich současná diagnostika je založena na kombinaci specifičnosti hostitele, symptomech a mikroskopii. Ačkoli bývá význam fenotypových rysů diskutován, mikroskopická pozorování zůstávají nenahraditelnými. Tato metoda je však silně závislá na praxi a zkušenostech fytopatologa. Navrhujeme vypracovat alternativní přístup založený na hmotnostní spektrometrii, která vyžaduje pouze malé množství materiálu a přitom využívá velmi rychlého a relativně jednoduchého zpracování vzorku a interpretace dat. Vyhledávání v databázi založené na porovnávání typických a neznámých hmotnostních spekter umožňuje identifikaci a taxonomickou klasifikaci mikroorganismů např. analýzou hlavních komponent. Většina plánovaných experimentů bude založena na hmotnostně spektrometrické analýze povrchových proteinů uvolněných působením kyseliny na rostlinné patogeny. V rámci projektu se předpokládá předání know-how rak
Title	Identification and biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry (en) Identifikace a biotypizace fytopatogenů kulturních rostlin pomocí hmotnostní spektrometrie
skos:notation	MEB061003
http://linked.open...avai/cep/aktivita	KONTAKT
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/MEB061003/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/MEB061003/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2012-07-12 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	M2 - Mezinárodní spolupráce podle uzavřených smluv o dvoustranné mezinárodní spolupráci ve VaV
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	91776556
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	biotyping; matrix-assisted laser desorption/ionization; mass spectrometry; microorganism; mildew; plant pathogen (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2011-04-21 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/7535%2F2010-32
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2011
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2012
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2011-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CB - Analytická chemie, separace EF - Botanika
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	An alternative diagnostic approach for fungal phytopathogens was investigated utilizing intact spore MALDI-TOF mass spectrometry. Experimental work involved optimization of sample preparation method and measurements from infected host’s leaves. (en) Byl zkoumán alternativní přístup diagnostiky fytopatogenů s využitím MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie intaktních spor. Experimenty zahrnovaly optimalizaci metody přípravy vzorku a přímá měření z infikovaných listů hostitele. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	biotyping mass spectrometry microorganism matrix-assisted laser desorption/ionization mildew
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	MALDI-based intact spore mass spectrometry of downy and powdery mildews
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/MEB061003/2010/orjk%3A15310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/MEB061003/2011/orjk%3A15310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/MEB061003/2012/orjk%3A15310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 8 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software