About: Posttranscriptional modifications of tRNAs in Trypanosoma brucei

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Posttranscriptional modifications of tRNAs in Trypanosoma brucei Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=LH12104
Description	One of the striking features of tRNAs is their numerous post-transcriptional modifications. A large number of enzymes required for different modifications have now been identified in many model organisms, but despite some progress little is known about modification enzymes in Trypanosoma brucei, an evolutionarily divergent and medically very important protist. Some tRNA modification enzymes target the anticodon loop of various tRNAs and can impact cytoplasmic and mitochondrial protein synthesis. Importantly, several of them either need iron-sulfur (Fe-S) cluster or use components of the Fe-S cluster assembly pathway for their activity. The proposed aim of this project is to study tRNA modifications such as thiolation, methylation and wybutosine formation in T. brucei. Our objective is to determine their subcellular localization and their biological roles in the given compartment. The obtained results will elucidate different tRNA maturation pathways and their dependence on Fe-S clusters. (en) Tento projekt si klade za cíl studovat nejrůznější aspekty tRNA modifikací u parazitického prvoka Trypanosoma brucei. Konkrétně nás zajímá, jak různé modifikace ovlivňují import tRNA do mitochondrie. Domníváme se, že některé modifikace by mohli zabraňovat importu a tím regulovat poměr tRNA v cytosolu a mitochondrii. Dále se chceme zabývat rolí modifikací tRNA při translaci mitochondriálně kódovaných proteinů. Jejich výskyt v mitochondrii dáváme do souvislosti s rozsáhlým editováním mitochondriálních transkriptů, které tímto mechanismem získají velký počet uridinů. Modifikované tRNA zajišťují správné čtení genetické informace a zabraňují sklouzávání ribozomu. A v neposlední řadě se zaměříme na studium provázanosti dráhy pro tvorbu Fe-S center a tRNA modifikačních enzymů. Řada těchto enzymů totiž potřebuje pro svoji aktivitu Fe-S centra, která vznikají de novo v mitochondrii. Nicméně připouštíme i možnost, že se proteiny Fe-S dráhy účastní přímo tvorby tRNA modifikací.
Title	Posttranscriptional modifications of tRNAs in Trypanosoma brucei (en) Posttranskripční úpravy tRNA u trypanosomy spavičné
skos:notation	LH12104
http://linked.open...avai/cep/aktivita	KONTAKT II
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/LH12104/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/LH12104/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-02-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	101047264
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Trypanosoma; mitochondrion; tRNA modification; thiolation; methylation; wybutosine; Fe-S cluster; import (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-06 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/MSMT-6805%2F2013-311
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMSM2012LH2
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EE - Mikrobiologie, virologie FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-03-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBK
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Trypanosoma methylation mitochondrion Fe-S cluster tRNA modification thiolation wybutosine
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Mitochondrial and Nucleolar Localization of Cysteine Desulfurase Nfs and the Scaffold Protein Isu in Trypanosoma brucei Both human ferredoxins equally efficiently rescue ferredoxin deficiency in Trypanosoma brucei The T. brucei TRM5 methyltransferase plays an essential role in mitochondrial protein synthesis and function Characterization of Two Mitochondrial Flavin Adenine Dinucleotide-Dependent Glycerol-3-Phosphate Dehydrogenases in Trypanosoma brucei Divergence of Erv1-Associated Mitochondrial Import and Export Pathways in Trypanosomes and Anaerobic Protists The Importance of the 45 S Ribosomal Small Subunit-related Complex for Mitochondrial Translation in Trypanosoma brucei Comparative analysis of respiratory chain and oxidative phosphorylation in Leishmania tarentolae, Crithidia fasciculata, Phytomonas serpens and procyclic stage of Trypanosoma brucei Cytosolic iron-sulphur protein assembly is functionally conserved and essential in procyclic and bloodstream Trypanosoma brucei Solanesyl Diphosphate Synthase, an Enzyme of the Ubiquinone Synthetic Pathway, Is Required throughout the Life Cycle of Trypanosoma brucei
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LH12104/2012/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LH12104/2013/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LH12104/2014/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LH12104/2015/ico%3A60077344

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 46 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software