About: Quantification and localization of maternal mRNAs in early development of Xenopus

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Quantification and localization of maternal mRNAs in early development of Xenopus Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB500520601
Description	Cell determination during early development is a process that directly depends on protein and mRNA cell content and distribution. mRNA profiling is limited by small amounts of RNA in mammalian cells. On the contrary, single Xenopus early cells and eggs contain enough mRNA for extensive screening. I therefore, propose, by real-time PCR, to quantify mRNA levels of 40 highly expressed maternal genes at the level of individual cells from the egg to the stage of 16 cell embryos to create 3D temporal and spatial expression maps of mRNA distributions for the studied genes during early development. The maps will provide correlations between mRNA distributions and cell determination/fate. The maps will serve as a framework for studies of other maternal genes of unknown function. These genes will be subsequently studied by functional analysis (RNAi or morpholino inhibition, and overproduction) to determine their function. (en) Buněčná diferenciace během časného vývoje je děj plně závislý na množství a distribuci jednotlivých proteinů a mRNA v buňkách. U savců je kvantifikace mRNA omezena malým množstvím RNA v buňce. Časné embryonální buňky a vajíčka drápatky (Xenopus) obsahují však dostatečné množství RNA pro rozsáhlá měření. Z tohoto důvodu navrhuji pomocí kvantitativní PCR stanovit hladiny mRNA 40 různých maternálních genů v jednotlivých buňkách od vajíčka po 16-ti buňková embrya. Z výsledků bude sestavena 3D mapa genové exprese a distribuce mRNA v jednotlivých buňkách embryí. Z této mapy bude možno odvodit spojení distribuce mRNA s vývojovými pochody a tím s funkcí genu v časném vývoji. Následně bude mapa sloužit jako předloha pro ostatní maternální geny a pro předpověď jejich účinku. Funkce těchto genů bude dále studována pomocí nadprodukce nebo inhibice.
Title	Quantification and localization of maternal mRNAs in early development of Xenopus (en) Kvantifikace a lokalizace maternálních mRNA v časném vývoji drápatky (Xenopus)
skos:notation	KJB500520601
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB500520601/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB500520601/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2009-04-03 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	71781895
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Xenopus; single cell; real-time PCR; transcription; mRNA; distribution, early development (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2007-02-27 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/KJB500520601
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2007
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2008
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02006-B
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2007-12-01 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2006-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byla vyvinuta nová metoda pro prostorové expresní profilování, nazvaná qPCR tomografie. Vajíčka a embrya Xenopus laevis byla použita pro vytvoření prostorové expresní mapy maternálních genů. Byly nalezeny pouze dvě skupiny různých lokalizačních profilů (cs) Novel method for spatial expression profiling, called qPCR tomography, was developed. Xenopus laevis oocytes and early embryos were used to create spatial expression map of maternal genes. Only two groups of localization patterns were found. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Xenopus distribution mRNA real-time PCR transcription single cell
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Intracellular expression profiles measured by real-time PCR tomography in the Xenopus laevis oocyte The N-terminal region is crucial for the thermostability of the G-domain of Bacillus stearothermophilus EF-Tu Real-time PCR gene expression profiling
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB500520601/2006/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB500520601/2007/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB500520601/2008/ico%3A68378050

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 78 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software