About: Synthesis and evaluation of azaphthalocyanine derivatives as fluorescence quenchers

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Synthesis and evaluation of azaphthalocyanine derivatives as fluorescence quenchers Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB401100801
Description	The project is focused on the synthesis and evaluation of a new structural type of fluorescence quenchers used in non-radiative labeling of biomolecules. Fluorescence labeling is widely used method for biomolecule detection. Some methods in DNA detection and quantitative analysis employ combination of two dyes, of which the first is a fluorescent one and the other is a %22quencher%22 of fluorescence. This project is focused on the quenchers suitable for fluorophores emitting light at (but not only) higher wavelengths, where some challenge still remains due to insufficient stability of the quenchers. Proposed azaphthalocyanine (AzaPc) molecules possess several advantageous properties for such application and are chemically stable. Project solves not only synthesis but also biomolecular evaluation of the quenching efficiency of newly prepared compounds using hybridization assays. Both static and dynamic (FRET) quenching will be tested. (en) Předkládaný projekt si klade za cíl připravit a hodnotit novou skupinu zhášečů fluorescence pro značení biomolekul, zejména oligonukleotidových sond. Fluorescenční značení biomolekul je v současnosti velice rozšíření biomolekulární metoda detekce. Jedna z metod využívá dvě barviva – jedno fluorescenční a druhé fungující jako zhášeč fluorescence. Tento projekt je zaměřen na syntézu a hodnocení zhášečů fluorescence pro fluorofory emitující (nejen) při vyšších vlnových délkách, kde v současné době stále zůstává stále problém s dostupnými zhášeči, zejména co se týče jejich chemické stability. Navržené struktury azaftalocyaninů (AzaPc), které dosud nebyly v této aplikaci nikdy použity, mají řadu velice výhodných vlastností pro tuto aplikaci a jsou chemicky stabilní. Projekt řeší syntézu vhodných AzaPc i biomolekulární testy nových zhášečů použitím hybridizací značených oligonukleotidových sond. Obě možnosti zhášení fluorescence – statické i dynamické zhášení (FRET) - budou testovány.
Title	Synthesis and evaluation of azaphthalocyanine derivatives as fluorescence quenchers (en) Syntéza a hodnocení azaftalocyaninů jako zhášečů fluorescence
skos:notation	KJB401100801
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB401100801/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB401100801/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2011-06-14 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	82505132
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CC - Organická chemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	phthalocyanine; azaphthalocyanine; fluorescence; oligonucleotide; dark quencher; hybridization assays (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Farmaceutická fakulta v Hradci Králové
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2010-03-09 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/KJB401100801
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2010
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2011
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02008-B
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2010-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2008-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byly syntetizovány nové azaftalocyaniny, navázány na pevnou fázi a následně proběhla syntéza značených oligonukleotidů. S takto značenými oligonukleotidy bylo potvrzeno zhášení fluorescence v DNA hybridizačních testech se širokou škálou fluoroforů. (cs) New azaphthalocyanines were synthesized, attached to solid phase and labeled oligonucleotides were prepared. The oligonucleotides were introduced into DNA hybridization assays that confirmed high quenching efficiency with a range of fluorophores. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	phthalocyanine fluorescence azaphthalocyanine dark quencher oligonucleotide
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Ultrafast intramolecular charge transfer in tetrapyrazinoporphyrazines controls the quantum yields of fluorescence and singlet oxygen Solid-phase synthesis of azaphthalocyanine-oligonucleotide conjugates and their evaluation as new dark quenchers of fluorescence Synthesis of new azaphthalocyanine dark quencher and evaluation of its quenching efficiency with different fluorophores
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB401100801/2008/orjk%3A11160 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB401100801/2009/orjk%3A11160 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB401100801/2010/orjk%3A11160 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB401100801/2011/orjk%3A11160

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software