About: Construction of banana bacterial artificial chromosome (BAC) library for physical genome mapping

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Construction of banana bacterial artificial chromosome (BAC) library for physical genome mapping Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA6038204
Description	The project aims at producing of an ardered large-insert banana B-genome library. The library will be cloned in pECBACl vector. The final genomic library will be combination of three partial libraries constructed using various restriction enzymes. which should increase the real genome coverage. We will attempt in obtaining 30 000 - 35 000 clones with expected average insert size of 100 130 kb, which will represent wix equivalents to haploid genome. The library will be used for cytogenetic mapping with the aim to obtain cytogenetic markers to distinguish individual chromosomes and to saturate cytogenetic maps of banana. The acqured markers will permit analysis of chromosome evolution within the genus Musa for the first time. Integration of banana genetic and physical maps will be another achievement of the project. It is expected that the library wil be used intensively in other projects within the framework of international cooperation. (en) Bude připravena uspořádaná knihovna velkých inzertů pro B genom banánovníku. Knihovna bude klonována ve vektoru pECBACl a vznikne kombinací tří dílčích knihoven, vytvořených za použití různých restrikčních endonukleáz, což zajistí její vyšší reprezentativnost. Cílem bude získání 30 000 - 35 000 rekombinantních klonů, což by při předpokládané průměrné velikosti inzertů 100 - 130 kbp představovalo minimálně šestinásobné pokrytí genomu. Knihovna bude využita pro fyzické mapování genomu banánovníku. Cílem bude získat cytogenetické markery použitelné pro rozlišení jednotlivých chromozómů a následně zahustit cytogenetickou mapu banánovníku. Získané cytogenetické markery umožní vůbec poprvé analyzovat evoluci karyotypu v rámci rodu Musa. Významným výsledkem bude integrace genetické a fyzické mapy. Předpokládá se intenzívní využívání knihovny v dalších projektech v rámci mezinárodní spolupráce.
Title	Construction of banana bacterial artificial chromosome (BAC) library for physical genome mapping (en) Konstrukce knihovny DNA banánovníku klonované ve vektoru BAC (Bacterial artificial chromosome) pro fyzické mapování genomu
skos:notation	IAA6038204
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA6038204/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA6038204/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-09-26 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33614512
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	BAC library; Banana; Chropmosome landmarks; Karyotype evolution; Musa balbisiana; Fluorescence in situ hybridization; Physical genome mapping (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	17 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	17 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2002
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02002-AB
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EF - Botanika GE - Šlechtění rostlin
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byly připraveny unikátní materiály pro genomiku banánovníku, zejména genomická knihovna DNA klonovaná ve vektoru BAC. S jejich pomocí byly získány nové poznatky o molekulární struktuře genomu této významné plodiny a jeho změnách v průběhu evoluce. (cs) Novel resources for banana genomics, including a genomic DNA library cloned in a BAC vector were prepared. They were used to obtain new findings on the structure of nuclear genome of the important crop and its changes accompanying the evolution. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	BAC library Banana Chropmosome landmarks Fluorescence in situ hybridization Karyotype evolution Musa balbisiana
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Cytogenetic and cytometric analysis of nuclear genome in Musa Detecting ploidy level instability of banana embryogenic cell suspension cultures by flow cytometry Creation of a BAC resource to study the structure and evolution of the banana (Musa balbisiana) genome Identification of Musa chromosomes by fluorescence in situ hybridization with BAC clones. Nuclear genome size and genomic distribution of ribosomal DNA in Musa and Ensete (Musaceae): taxonomic implications Focus on the Musa collection: Ploidy levels revealed. Isolation of highly repetitive DNA sequences in Musa acuminata using rassociation kinetics Variation in chromosome numbers and nuclear DNA contents in genetic resources of Lactuca L. species (Asteraceae). Diversity in genomic distribution of ribosomal DNA and nuclear genome size in Musa. Molecular cytogenetics and cytometry of banana (Musa spp.) Development of flow cytogenetics and physical genome mapping in chickpea (Cicer arietinum L.). Flow kaiyotyping and chromosome sorting in bread wheat (Triticum aestivum L). Ploidy identification of doubled chromosome number plants in Viola x wittrockiana Gams. M1-generation. Usefulness of embryogenic cell suspension cultures for the induction and selection of mutations in Musa spp solation, characterization and chromosome localization of repetitive DNA sequences in bananas (Musa spp.). Rapid detection of aneuploidy in Musa using flow cytometry. Preparation of HMW DNA from plant nuclei and chromosomes isolated from root tips.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038204/2002/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038204/2003/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038204/2004/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038204/2005/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038204/2006/ico%3A61389030

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software