About: Improvement of the long-term expression and anti-methylation protection of RSV based retroviral vectors

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Improvement of the long-term expression and anti-methylation protection of RSV based retroviral vectors Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA5052207
Description	Rous sarcoma virus (RSV), chicken retrovirus transducing the v-src oncogene, is mostly inactivated at the level of transcription after integration into the heterologous mammalian cell genome. Such inactivation is probably caused by CpG methylation of the proviral DNA. Methylation within the regulatory sequences, so called long terminal repeats (LTR), is critical. RSV-based vectors are inactivated as well, being poorly useful for gene transfer into mammalian cell. We have recently shown that RSV LTR-driven proviruses can be protected from methylation and inactivation when adjacent to CpG islands. We plan to continue our studies with insertion of minimum necessary CpG island sequence and creation of RSV-based vectors suitable for mammalian cells. RSV does not replicate in mammalian cells, it cannot recombine with any endogenous retroviruses and cannot produce any infectious progeny. Using this approach, we can also recognize methylation of which CpGs determines the silencing of RSV LTR. (en) Virus Rousova sarkomu (RSV), kuřecí retrovirus transdukující onkogen v-src, je po integraci do genomu heterologní savčí buňky preferenčně inaktivován na transkripční úrovni. Pravděpodobnou příčinou této inaktivace je methylace provirové DNA, přičemž kritická je methylace regulačních sekvencí soustředěných v tzv. dlouhých koncových repetických (LTR). Stejně jako RSV se chovají vektory konstruované na jeho basi, což znemožňuje jejich použití pro transfer genů do savčí buňky. Recentně jsme ověřili, že proviry řízené RSV LTR mohou být chráněny před methylací a inaktivací v blízkosti ostrovů CpG. Chtěli bychom využít tohoto poznatku a inserovat do provirové DNA minimální sekvence ostrova CpG a vytvořit tak vektor na basi RSV vhodný pro savčí buňky. RSV se v buňkách savců nereplikuje, nemůže rekombinovat s endogenními viry a nemůže produkovat infekční virus. Těmito pokusy rovněž získáme informace o konkrétních dinukleotidech CpG, jejichž methylace podmiňuje inaktivaci, a o citlivosti LTR.
Title	Improvement of the long-term expression and anti-methylation protection of RSV based retroviral vectors (en) Zlepšení dlouhodobé exprese retrovirových vektorů a jejich ochrana před metylační supresí
skos:notation	IAA5052207
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA5052207/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA5052207/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-09-26 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	1721591
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	N - Nesplněno zadání, tj. nebyly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Rous sarcoma virus; RSV-based retroviral vectors; anti-methylation protection; CpG island (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2004
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2002
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2005
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2005
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02002-AB
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie FD - Onkologie a hematologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	We have shown that retroviral LTRs without CpG dinucleotides ensure long-term expression of integrated vectors and protect them from DNA methylation and transcriptional silencing. The results haven't been published yet. (en) Bylo prokázáno, že retrovirové LTR zbavené dinukleotidů CpG zajišťují dlouhodobou expresi integrovaných vektorů a brání jejich methylaci a transkripční supresi. Výsledky dosud nebyly zveřejněny. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Rous sarcoma virus RSV-based retroviral vectors anti-methylation protection
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	CpG methylation suppresses transcriptional activity of human syncytin-1 in non-placental tissues
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA5052207/2002/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA5052207/2003/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA5052207/2004/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA5052207/2005/ico%3A68378050

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software