About: Structural study of protein domains of monkey retrovirus

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Structural study of protein domains of monkey retrovirus Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA4055304
Description	Temporal and spatial separation of assembly of immature capsid particles from their release makes Mason-Pfizer monkey virus (M-PMV), inducing an AIDS like syndrom in non-human primates, an attractive experimental model for the study of retroviral capsid assembly and its maturation. Here we propose to study the 3D structure of the scaffolding protein p12 and the 13 kDa form of M-PMV protease (PR) using isotopicaly aided NMR spectroscopy. The role of the C-terminal extension of PR on its structure and higher proteolytic activity compared to the 3D structure of 12 kDa PR will be determined. We will also investigate the role of PR truncations in the virus life and the liberation of the M-PMV PR from the polyprotein precursors and its activation using tissue culture experiments. Using bacterial and in vitro assembly system we will determine the molecular mechanism and structure/function relations of Gag-derived domains involved in the assembly of retroviral capsid. (en) Sbalování nezralých virových částic a jejich uvolňování a zrání jsou u Mason-Pfizerova opičího viru časově i prostorově oddělené děje. Díky tomu je tento retrovirus, který způsobuje syndrom podobný AIDS u makaků, vhodným experimentálním modelem pro studium sbalování kapsid a procesu jejich zrání. V tomto projektu navrhujeme studovat trojrozměrnou strukturu 13 kDa formy proteasy (PR) a proteinu p12, který hraje roli při sbalování kapisd pomocí izotopově značené NMR spektrometrie. Důraz bude kladen na určení vlivu C-koncové extense molekuly proteasy na její strukturu a aktivitu. Proto bude stanovena struktura 13 kDa formy a porovnána s další formou vznikající při autokatalytickém štěpení tj. 12 kDa formou PR, jejíž 3D strukturu v současnosti dokončujeme. Zároveň bude sledován vliv zkracování molekuly proteasy na životní cyklus viru a uvolňování proteasy z prekursorů v závislosti na hladině jejich exprese v savčích buňkách.
Title	Structural study of protein domains of monkey retrovirus (en) Strukturní studie proteinových domén opičího retroviru
skos:notation	IAA4055304
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA4055304/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA4055304/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2013-06-28 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	71727910
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Mason-Pfizer monkey virus; retroviral protease; capsid protein; nucleocapsid protein; p12 protein; structure; NMR; processing; assembly of capsids (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	2 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	11 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	11 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2007-02-27 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/IAA4055304
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2007
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2008
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02003-A
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2007-12-01 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2003-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byla vyřešena 3D struktura M-PMV proteasy a M-PMV NC dUTPasy pomocí NMR a krystalografie. Určili jsme strukturní motivy M-PMV integrasy důležité pro vazbu inhibitorů. (cs) We solved the high resolution structure of M-PMV protease and M-PMV NC dUTPase using NMR and crystallography. We identified the structural motifs important for inhibitor binding to M-PMV integrase. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Mason-Pfizer monkey virus NMR capsid protein nucleocapsid protein p12 protein processing retroviral protease structure
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	The strand transfer oligonucleotide inhibitors of HIV-integrase The Role of the S-S Bridge in Retroviral Protease Function and Virion Maturation Amino acid residues in the cytoplasmic domain of the Mason-Pfizer monkey virus glycoprotein critical for its incorporation into virions Luminometric method for screening retroviral protease inhibitors Integrase of Mason-Pfizer monkey virus Distinct roles for nucleic acid in vitro assembly of purified Mason-Pfizer monkey virus CANC proteins dUTPase and nucleocapsid polypeptides of the Mason-Pfizer monkey virus form a fusion protein in the virion with homotrimeric organization and low catalytic efficiency. Three-dimensional structure of a monomeric form of a retroviral protease. Proteinases of betaretroviruses bind single-stranded nucleic acids through a novel interaction module, the G-patch Affect of cysteines on the activity and structure of 12 kda form of m-pmv protease-poster Affect of cysteines on the activity and structure of 12 kda form of m-pmv protease
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2003/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2003/orjk%3A22640 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2004/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2004/orjk%3A22640 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2005/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2005/orjk%3A22640 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2006/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2006/orjk%3A22640 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2007/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2007/orjk%3A22640 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2008/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA4055304/2008/orjk%3A22640

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 117 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software