About: Depicting a functional model of NTP303 mRNA translational repression during tobacco pollen maturation

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Depicting a functional model of NTP303 mRNA translational repression during tobacco pollen maturation Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GPP501/11/P321
Description	Posttranscriptional control of gene expression plays a vital role during tobacco pollen maturation and pollen tube growth. A pollen-specific gene NTP303 encoding N-glycosylated p69 kDa protein is an essential component of the pollen tube cell wall. The expression of NTP303 gene is detected early at pollen stage 3, however, the encoded mRNAs are translationally repressed and stored within characteristic ribonucleoprotein particles. At the initiation of pollen tube growth, stored NTP303 transcripts are massively translated and the encoded glycoprotein is deposited into the extending pollen tube wall. The aim of our project is to elucidate the mechanism(s) imposed to repress the translation of NTP303 mRNA during pollen maturation. Our objective is to use this unique model system to (i) isolate regulatory RNA binding protein(s) with a potential repressing activity that could participate in sequestering NTP303 mRNA translation and to demonstrate their function. Simultaneously, (ii) we also intend to investigate using in-depth sequencing approach a possible contribution of microRNAs as an alternative or additional mechanism imposed posttranscriptionally to modulate NTP303 expression during pollen maturation and pollen tube growth. (en) Posttranskripční kontrola genové exprese hraje zásadní roli při zrání pylu a následném růstu pylové láčky. Pylově specifický gen NTP303 kódující N-glykosylovanou bílkovinu o Mw 69 kDa je integrální složkou buněčné stěny pylové láčky stěny. Silná exprese genu NTP303 začíná již v časných stádiích vývoje pylového zrna, nicméně translace příslušných NTP303 mRNA je kompletně zablokována a tyto transkripty zůstávají uloženy v charakteristických ribonukleoproteinových částicích. Bezprostředně po vyklíčení pylu je iniciována masivní translace NTP303 transkriptů a kódovaný glykoprotein je ukládán ve stěně roztoucí pylové láčky. Cílem našeho projektu je objasnění mechanismu(ů) represe translace NTP303 mRNA během zrání pylu. Naším cílem je využít tento unikátní modelový systém k (i) izolaci bílkovin vázaných na NTP303 mRNAs pravděpodobnou regulační aktivitou, která blokuje její translaci a (ii) prokázat tuto regulační (represivní) funkci. Současně hodláme ověřit možný alternativní/souběžný mechanismus posttranslační inaktivace exprese NTP303 mRNA prostřednictvím mikroRNA, jak již bylo demonstrováno pro jiné geny.
Title	Depicting a functional model of NTP303 mRNA translational repression during tobacco pollen maturation (en) Mechanismus represe translace modelového transkriptu NTP303 během zrání pylu tabáku
skos:notation	GPP501/11/P321
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP501%2F11%2FP321/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP501%2F11%2FP321/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-06-25 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100662993
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	ED - Fyziologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	pollen male gametophyte proteomics translation regulation mRNP RNA-binding proteins microRNAs (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-06-07 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P501-11-P321
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2013
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2013-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	The junior project yielded valuable data dealing with regulation of translation in pollen cells. These results were published in two important international scientific journals and the principal investigator was always the first author. (en) Juniorský projekt přinesl cenné dílčí poznatky o regulaci translace v pylových buňkách. Jeho výsledky byly publikovány ve dvou kvalitních zahraničních vědeckých časopisech, kde byl řešitel vždy prvním autorem. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	De novo post-pollen mitosis II tobacco pollen tube transcriptome Comprehensive analysis of tobacco pollen transcriptome unveils common pathways in polar cell expansion and underlying heterochronic shift during spermatogenesis DEAD-Box RNA Helicases are among the Constituents of the Tobacco Pollen mRNA Storing Bodies In search of ligands and receptors of the pollen tube: the missing link in pollen tube perception
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP501%2F11%2FP321/2011/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP501%2F11%2FP321/2012/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP501%2F11%2FP321/2013/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP501%2F11%2FP321/2014/ico%3A61389030

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software