About: Preparation of lectins with high specificity and affinity

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Preparation of lectins with high specificity and affinity Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GPP207/11/P185
Description	Carbohydrate mediated recognition plays an important role in the ability of pathogenic bacteria to adhere to the surface of the host cell. Proteins, which are able to bind carbohydrates with very high affinity and specificity, are called lectins. Pseudomanas aeruginosa produces two lectins that contribute to the virulence of this pathogenic bacterium, which is major cause of morbidity and mortality in cystic fibrosis patients. One of the lectin displays an affinity for fucose in micromolar range, unusually high for monosaccharides binding. Searching in newly sequenced bacterial genomes and mutagenesis of lectins can lead to obtaining new proteins with interesting properties, e.g. proteins with fine-tuned affinity and specificity towards carbohydrates. A directed evolution is a powerful tool widely used for elucidating and relationship between protein sequence, structure and function. It is also an interesting method for preparation of proteins with altered and improved properties. Newly finding and characterized lectins can be used e.g. in biotechnology and for bioanalytical purposes. (en) Rozpoznávání sacharidů na povrchu hostitelské buňky hraje důležitou úlohu v proniknutí patogenní bakterie do hostitelské buňky. Proteiny schopné vázat cukry s velmi vysokou afinitou a specifitou se nazývají lektiny. Pseudomas aeruginosa produkuje dva rozpustné lektiny, které se podílejí na virulenci této bakterie, která je hlavní příčinou nemocnosti a úmrtnosti pacientů s cystickou fibrosou. Jeden z lektinů váže L-fukosu s velmi vysokou afinitou, pohybující se v mikromolární oblasti, což je pro lektiny velmi neobvyklé. Prohledávání nově sekvenovaných bakteriálních genomů a mutagenese lektinů může vést k získání nových proteinů se zajímavými vlastnostmi, např. se speciálně vyladěnou afinitou a specifitou vůči sacharidům. Pro vysvětlení vztahu mezi sekvencí, strukturou a funkcí proteinu se často používá přístupu řízené evoluce. Je to také zajímavá metoda pro přípravu proteinů s pozměněnými a vylepšenými vlastnostmi. Nově objevené a popsané lektiny mohou být využity např. v biotechnologických a bioanalytických odvětvích.
Title	Preparation of lectins with high specificity and affinity (en) Příprava lektinů s vysokou specifitou a afinitou
skos:notation	GPP207/11/P185
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP207%2F11%2FP185/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP207%2F11%2FP185/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-07-15 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100240140
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	BO - Biofyzika
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	lectin pathogen oligosacharide mutagenesis Pseudomonas aeruginosa 3D-structure (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-06-12 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P207-11-P185
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2014
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2014-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKK
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Production of Ca-dependent high-affinity lectins with defined specificity by mutagenesis of PA-IIL lectin Specificity and affinity modulation of PA-IIL lectin Influence of targeted amino acid substitution on specificity and affinity of lectins from pathogenic bacteria Protein engineering of lectins - in silico and in vitro approaches
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP207%2F11%2FP185/2011/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP207%2F11%2FP185/2012/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP207%2F11%2FP185/2013/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP207%2F11%2FP185/2014/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 80 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software