| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - AtTRB proteins are members of the SMH family defined by N-terminal Myb domain, central region with H1/5 domain and coiled-coil domain near C-terminus. SMH family is exclusively plant specific. Members of the SMH family are not only telomeric sequence binding due to their telobox-type Myb domain but they are also likely to regulate promotor sequences in various genes. So far we have characterized three SMH proteins. Although each of them is ds-telomeric repeat binding, some of them are also G-rich strand binding and they further differ in their ability to interact with other proteins, as was determined by the yeast two-hybrid system. The aim of this project is to find interaction partners of the SMH proteins directly in plant system via TAP-tag which allows two-step protein purification under native conditions. This project should also answer the question whether the AtTRB proteins are telomere localized or whether they distinguish interstitial telomeric repeats within promoter regions. The (en)
- Proteiny AtTRB patří do skupiny SMH proteinů, které jsou definovány přítomností Myb domény na svém N-konci, centrální H1/5 doménou a C-koncovou coiled-coil doménou. Proteiny typu SMH jsou specifické pouze pro rostlinnou říši a jejich členové se váží Myb doménou typu telobox nejen na rostlinné telomerické repetice, ale také mohou mít regulační funkci v promotorech jiných genů. Do současné doby byly v naší laboratoři charakterizovány tři proteiny z této skupiny. Ačkoliv byla u všech proteinů prokázána specifická vazba na ds-telomerické repetice a u některých také na G-bohaté vlákno telomerické repetice, v dvojhybridním systému se jednotlivé proteiny významně liší svými interakčními partnery. Cílem tohoto projektu je vyhledat interakční partnery přímo v rostlinném systému pomocí metody TAP-tag, která umožňuje šetrnou dvojkrokovou purifikaci proteinů. Projekt by měl také s použitím ChIP analýzy pomoci vyřešit otázku, zda jsou AtTRB proteiny lokalizovány na telomerách a nebo rozeznávají intersticiální
|
| Title
| - Characterisation of functional diversity of the plant-specific SMH family of proteins (en)
- Charakterizace a funkční diverzita proteinů rodiny SMH, která je specifická pro rostliny
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - protein expression; protein-protein interaction; DNA-protein binding; chromatin immunoprecipitation (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - Grantová agentura České republiky Grantová agentura České republiky Řešení projektu \%22Charakterizace a funkční diverzita proteinů rodiny SMH, která je specifická pro rostliny\%22 přineslo původní výsledky v oblasti analýzy chování rostlinných AtTRB proteinů in vitro i in vivo. V rámci projektu byla zpřesněna jejich vazebná specificita, navržen model vazby jednotlivých domén AtTRB protein (cs)
- The work on the project “Characterisation of functional diversity of the plant-specific SMH family of proteins” has brought original results regarding the analysis of the role of the plant AtTRB proteins in vitro or in vivo. The solution of the project has resulted in the following outputs: clarification of the AtTRB binding specificity; design of a binding model of the separate AtTRB domains to (en)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - protein expression
- DNA-protein binding
- protein-protein interaction
|
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)