About: Study of posttranslation modification of the tumor suppressor protein p53, its homologues and interacting proteins in human cancer cell lines

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Study of posttranslation modification of the tumor suppressor protein p53, its homologues and interacting proteins in human cancer cell lines Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP301/07/P160
Description	Detailed knowledge of modification and DNA binding activity of p53 protein is fundamental for understanding of p53-dependent pathways. In our study we intend to analyze in detail posttranslational modifications of the p53 protein, influence of p53 modification on its DNA binding and changes of the p53 activity induced by genotoxic treatment in human cancer cell lines. Phosphorylation and acetylation of p53 belong to the key mechanisms of modulation of the p53 interactions with DNA or with other proteins. Using monoclonal antibodies we will analyze the most frequent p53 modifications in cell lines treated with 5-fluorouracil, doxorubicin, cis-platin, and/or other chemotherapeutic agents. DNA superhelicity can play important role in modulation ofp53 binding to its DNA response elements. We will thus study binding of the p53 proteins to linear and supercoiled DNA targets using gel shift analysis in agarose gel. In addition, we will study cell cycle and apoptotic response to the genotoxic (en) Detailní znalosti modifikací a DNA vazebné aktivity proteinu p53 jsou zásadní pro pochopení p53 zprostředkované odpovědi na genotoxické působení v buňce. V naší studii chceme podrobně analyzovat posttranslační modifikace proteinu p53, jejich vliv na vazbu p53 na DNA a změny vazebných vlastností proteinu p53, ke kterým dochází při působení chemoterapeutik u lidských nádorových buněčných linií. Fosforylace a acetylace proteinu p53 jsou jedněmi z klíčových mechanizmů regulace vazby proteinu p53 k jeho cílovým sekvencím na DNA a jeho interakcí s dalšími proteiny. Pomocí specifických monoklonálních protilátek budeme charakterizovat nejčastější modifikace proteinu před a po působení 5-fluorouracilu, doxorubicinu, cis-platiny a dalších klinicky významnýchterapeutických agens. Ke stanovení DNA vazebné aktivity použijeme gelovou retardační analýzu v agarózovém gelu. Selektivita vazby proteinu p53 k jeho cílovým sekvencím je do značné míry ovlivněna superhelicitou DNA, proto se ve své studii chceme zaměřit
Title	Study of posttranslation modification of the tumor suppressor protein p53, its homologues and interacting proteins in human cancer cell lines (en) Studium posttranslační modifikace nádorového supresoru proteinu p53, jeho homologů a interagujících proteinů v lidských nádorových buněčných liniích
skos:notation	GP301/07/P160
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP301%2F07%2FP160/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP301%2F07%2FP160/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-01-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65825607
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	p53; p73; p63; posttranslation modification (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-04-22 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/301%2F07%2FP160
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02007GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie FD - Onkologie a hematologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	. (en) Po doplnění úplných citací prací a opravení hrubých gramatických chyb je možné uznat závěrečnou zprávu za dostačující a projekt hodnotit jako vynikající. Formální chyby zprávy byly po upozornění opraveny. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	p53 p63 p73
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	DNA topology influences p53 sequence-specific DNA binding through structural transitions within the target sites The central region of BRCA1 binds preferentially to supercoiled DNA The potential of the cruciform structure formation as an important factor influencing p53 sequence-specific binding to natural DNA targets Selective binding of tumor suppressor p53 protein to topologically constrained DNA: Modulation by intercalative drugs
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP301%2F07%2FP160/2007/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP301%2F07%2FP160/2008/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP301%2F07%2FP160/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP301%2F07%2FP160/2010/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software