About: Studium vztahu struktury a funkce FGF2 oligomerů tvořících membránové póry technikami zaměřenými na sledování jedné molekuly

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Studium vztahu struktury a funkce FGF2 oligomerů tvořících membránové póry technikami zaměřenými na sledování jedné molekuly Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GC14-03141J
Description	Fibroblast Growth Factor 2 (FGF2) has numerous biological activities, which are exerted when FGF2 is secreted into the extracellular space. It however lacks a signal peptide that would translocate it to the endoplasmatic reticulum and enable using of the classical secretory pathway. It directly binds to the inner plasma membrane leaflet in the PI(4,5)P2 dependent manner, and by forming a membrane pore it spans over the entire bilayer, and eventually forms a ternary complex with heparan sulfate proteoglycans and high affinity FGF receptor outside the cell (unconventional secretion). Only little is known about the structure of the FGF2 oligomers and the lipidic membrane pores, that intermediate FGF2 membrane translocation. Therefore we propose advanced fluorescence microscopy techniques to study this phenomenon, which allow for answering fundamental questions regarding structure and dynamics of the membrane inserted proteins. The ultimate goal is to fully characterize FGF2 based membrane structures in terms of aggregation number, size, diffusion properties, nano-platform occupancy etc. (en) FGF2 (fibroblast growth factor 2) má široké spektrum biologických aktivit. Přestože se jedná o protein, jehož funkce se odehrávají vně buněk, postrádá tento protein signalizační peptid, který by umožňoval jeho lokalizaci do endoplazmatického retikula (ER) a následně jeho vyloučení běžnou cestou za pomocí ER a Golgiho aparátu. Namísto toho se FGF2 váže přímo na vnitřní část plazmatické membrány pomocí lipidu PI(4,5)P2 a v důsledku vytvoření lipidového póru projde skrz membránu a nakonec utvoří ternární komplex s heparan sulfátovými proteoglykany a vysoce afinním FGF receptorem vně buněk. V současné době se o agregaci FGF2 na mebráně a vzniku zmíněných pórů umožňující translokaci proteinu a jeho vyloučení tzv. nekonvenční cestou mnoho neví. Proto navrhujeme několik pokročilých fluorescenčních technik, které umožňují získat základní informace o struktuře a dynamice membránově vázaného FGF2. Hlavním cílem navrhovaného projektu je plně charakterizovat jeho membránové struktury ve smyslu agregačního čísla, velikosti, difúzních vlastnosti a kolokalizace s membránovými “rafty”.
Title	Studium vztahu struktury a funkce FGF2 oligomerů tvořících membránové póry technikami zaměřenými na sledování jedné molekuly Exploring the structure function relationship of membrane-pore-forming FGF2 oligomers - a single molecule approach (en)
skos:notation	GC14-03141J
http://linked.open...avai/cep/aktivita	International projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GC14-03141J/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GC14-03141J/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-03-20 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	101142858
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	BO - Biofyzika
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	unconventional protein secretion, fluorescence correlation spectroscopy, antibunching, Foerster resonance energy transfer, liposomes (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-14 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/14-03141J
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201400002
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2014-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Foerster resonance energy transfer antibunching fluorescence correlation spectroscopy unconventional protein secretion
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Time-Resolved Fluorescence in Lipid Bilayers: Selected Applications and Advantages over Steady State
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GC14-03141J/2014/ico%3A61388955 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GC14-03141J/2015/ico%3A61388955 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GC14-03141J/2016/ico%3A61388955

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software