About: The Ras superfamily of GTPases and the evolution of the eukaryotic cell

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The Ras superfamily of GTPases and the evolution of the eukaryotic cell Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/10/0205
Description	The Ras superfamily of GTPases comprises central components of many important pathways in the eukaryotic cell and is implicated in severe human diseases, but its global sequence and structural diversity and evolution remains largely unexplored. This project builds on the recent progress in genome sequencing and in bioinformatic an phylogenetic methods and aims at a detailed evolutionary and sequence analysis of eukaryotic Ras superfamily GTPases. We will analyse data from public databases and from on-going genome projects for unicellular eukaryotes Bigelowiella natans, Guillardia theta and Mastigamoeba balamuthi. An extensive taxonomically-rich dataset of GTPases will be subjected to exhaustive sequence and structural analyses. We will define evolutionary relationships within the superfamily via detailed phylogenetic analyses. The reconstructed evolutionary history of the superfamily will be correlated with major events in the evolution of eukaryotes and the eukaryotic cell. We will create an Internet portal allowing wide access to the resources and tools generated in the project. (en) Nadrodina Ras GTPáz zahrnuje ústřední složky mnoha významných drah v eukaryotické buňce a hraje roli ve vážných lidských chorobách, ale její celková sekvenční a strukturní diverzita a evoluce zůstávají v podstatě neprobádány. Tento projekt staví na současném pokroku v genomovém sekvenování a metodách bioinformatiky a fylogenetiky a má za cíl podrobnou evoluční a sekvenční analýzu nadrodiny Ras GTPáz u eukaryot. Pro analýzy využijeme sekvenční data z veřejných databází a z probíhajících genomových projektů pro jednobuněčná eukaryota Bigelowiella natans, Guillardia theta a Mastigamoeba balamuthi. Rozsáhlý taxonomicky bohatý datový soubor podrobíme detailní analýze sekvencí a proteinových struktur. Podrobnou fylogenetickou analýzou vymezíme evoluční vztahy v rámci nadrodiny a její zrekonstruovanou evoluční historii porovnáme s hlavními událostmi v evoluci eukaryot a eukaryotické buňky. Vybudujeme rovněž internetový portál umožňující přístup vědecké komunitě k datovým souborům a nástrojům vyvinutým v rámci projektu.
Title	The Ras superfamily of GTPases and the evolution of the eukaryotic cell (en) Nadrodina Ras GTPáz a evoluce eukaryotické buňky
skos:notation	GAP305/10/0205
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F10%2F0205/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F10%2F0205/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-01-30 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	92536421
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	GTPases; genomics; evolution; eukaryotic; cell (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	10 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	10 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2012-03-30 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P305%2F10%2F0205
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2012
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2013
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02010GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2012-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Projekt přinesl nové poznatky nejen o GTPázách nadrodiny Ras a jejich diverzitě a evoluci, ale také o obecnějších aspektech evoluce eukaryotické buňky a jejího molekulárního základu. Projekt byl velice úspěšný. Stanovené cíle byly z větší části dosaženy a výsledky publikovány ve 5 publikacích s IF s dedikací na projekt a 3 publikacích, u nichž dedikace chybí. (cs) Project provided insight not only about Ras superfamily GTPases and their diversity and evolution, but also about more general aspects concerning the evolution of the eukaryotic cell. Very successful project. Original aims were mostly achieved and the results were published in 5 papers in impacted journals with dedication to the project and 3 additional publications without grant dedication. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	GTPases eukaryotic evolution genomics
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Pan genome of the phytoplankton Emiliania underpins its global distribution The Ectocarpus genome and the independent evolution of multicellularity in brown algae Algal genomes reveal evolutionary mosaicism and the fate of nucleomorphs Ancient complexity, opisthokont plasticity, and discovery of the 11th subfamily of Arf GAP proteins Highly Dynamic Exon Shuffling in Candidate Pathogen Receptors ? What if Brown Algae Were Capable of Adaptive Immunity? SH3 Domain Tyrosine Phosphorylation - Sites, Role and Evolution Sculpting the endomembrane system in deep time: high resolution phylogenetics of Rab GTPases The Ras related GTPase Miro is not required for mitochondrial transport in Dictyostelium discoideum Rho GTPases: deciphering the evolutionary history of a complex protein family Genome structure and metabolic features in the red seaweed Chondrus crispus shed light on evolution of the Archaeplastida
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0205/2010/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0205/2010/orjk%3A17310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0205/2011/orjk%3A17310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0205/2012/orjk%3A17310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0205/2013/orjk%3A17310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software