About: Analysis of protein complexes of killer cell receptors using chemical cross-linking, surface labeling, isotope exchange, mass spectrometry and NMR.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Analysis of protein complexes of killer cell receptors using chemical cross-linking, surface labeling, isotope exchange, mass spectrometry and NMR. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP207/10/1040
Description	Natural killer cells do not express at their surface a single dominant activation receptor similar to the T or B cell receptor. Therefore, the immune effector functions of these cells are regulated by a large number of receptors conferring either inhibitory or activation signals as a part of the large receptor zipper. In order to understand the mechanisms details beyond the recognition of tumor or virally infected cells by natural kille cells, it is essential to study the molecular details of receptor – ligand interactions using highly purified soluble receptors. In the present project we suggest to produce at least four highly soluble recombinant receptors of natural killer cells and their potential ligands, namely mNKR-P1A, mNKR-P1C, mNKR-P1F, and mClr-g, and to study their interactions and the structure of the receptor – ligand complexes using chemical cross-linking, H – D exchange, mass spectrometry, and protein NMR. (en) Přirozené zabíječské buňky neexprimují na svém povrchu jediný dominantní aktivační receptor, ale jejich efektorové funkce jsou regulovány celou řadou receptor - ligandových interakcí tvořících tzv. receptorový zip. Pro lepší pochopení molekulárních mechanismů rozpoznání nádorových a virově infikovaných buněk přirozenými zabíječskými buňkami je nezbytné studovat tyto interakce receptorů s cílovými ligandy jednotlivě s použitím vysoce purifikovaných receptorů. V předkládaném projektu navrhujeme produkovat nejméně 4 vysoce rozpustné receptory přirozených zabíječských buněk a jejich ligandy, a poté studovat komplexy receptor - ligand pomocí chemických síťovacích činidel, isotopové výměny, hmotnostní spektrometrie a proteinové NMR.
Title	Analysis of protein complexes of killer cell receptors using chemical cross-linking, surface labeling, isotope exchange, mass spectrometry and NMR. (en) Strukturní analýza proteinových komplexů přirozených zabíječů pomocí chemického zesítění, isotopové výměny, hmotnostní spektrometrie a NMR.
skos:notation	GAP207/10/1040
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP207%2F10%2F1040/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP207%2F10%2F1040/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-07-01 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100267022
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CD - Makromolekulární chemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	protein complexes chemical cross-linking isotope exchange mass spectrometry nuclear magnetic resonance molecular dynamic (en)
http://linked.open...neniPrubehuReseni	At the request of the applicant or GACR (not registered in the GACR system) (en) Na žádost žadatele nebo GAČR (není v systému GAČR evidováno) (cs)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-02-28 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P207-10-1040
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2012
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02010GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUS
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EC - Imunologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Řešení projektu odpovídalo záměrům. Výsledkem je pět publikací. Projekt byl ale po třech letech řešení panelem předčasně ukončen. Důvodem byla účast Prof. Bezoušky usvědčeného ze „scientific misconduct“ a jeho podíl na publikacích vzešlých z projektu a zabývajících se NKR receptory, kterých se neetické počínání Prof. Bezoušky týkalo. Proto je možné ohodnotit projekt pouze jako splněný s výhradou. (cs) The grant project followed the aims and resulted in five publications. After three years, the project was aborted by the committee by reason of the participation of Prof. Bezouška who was found guilty of a scientific misconduct due to the unethical manipulations with NKR receptors and who co-authorized four project publications. The final evaluation of the project is “fulfilled with objections”. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBUS
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Effect of posttranslational modifications on enzyme function and assembly Molecular architecture of mouse activating NKR-P1 receptors MSTools-Web based application for visualization and presentation of HXMS data Structural Basis for the 14-3-3 Protein-dependent Inhibition of the Regulator of G Protein Signaling 3 (RGS3) Function Structural Model of Lymphocyte Receptor NKR-P1C Revealed by Mass Spectrometry and Molecular Modeling Chemical cross-linking and H/D exchange for fast refinement of protein crystal structure Mouse Clr-g, a Ligand for NK Cell Activation Receptor NKR-P1F: Crystal Structure and Biophysical Properties The alpha-galactosidase type A gene aglA from Aspergillus niger encodes a fully functional alpha-N-acetylgalactosaminidase High-level expression of soluble form of mouse natural killer cell receptor NKR-P1C(B6) in Escherichia coli
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F10%2F1040/2010/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F10%2F1040/2011/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F10%2F1040/2012/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F10%2F1040/2013/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F10%2F1040/2014/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software