About: Biophysical study of MntH membrane transport proteins: structure-function relationship

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Biophysical study of MntH membrane transport proteins: structure-function relationship Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA204/07/0558
Description	This project aims at bacterial transporters of divalent metal ions (DMI) from the Nramp/MntH family counting among the proton-dependent secondary active membrane transport proteins. Although the Nramp-related proteins, playing a key role in various physiological processes including macrophage-pathogen interaction, are present in virtually all organisms, the transport mechanism is not understood. We propose to advance knowledge of the structure-function relationship in the MntH/Nramp family by studying the function of key residues in vivo, in vitro (right-side out vesicles, in-side out vesicles and proteoliposomes) and in a peptide-membrane model system. The peptide model allows complementing the functional assays by information about transmembrane segment structure, insertion and folding, and possibly some functional details. We expect to collect data leading to the elucidation of DMI- and proton- translocation pathway in the MntH and to the characterization of some aspects of (en) Projekt je zaměřen na studium bakteriálních transportérů dvojmocných kovových iontů z rodiny Nramp/MntH patřících mezi sekundárně aktivní membránové transportní proteiny závislé na protonovém gradientu. Přestože jsou tyto proteiny, které hrají klíčovou roli v různých fyziologických procesech včetně interakce makrofág-patogen, přítomné prakticky ve všech organismech, není mechanismus transportu znám. Návrh počítá s prohloubením znalostí o vztahu struktury a funkce prostřednictvím studia vlivu klíčových reziduí na funkci membránových transportérů MntH in vivo, in vitro (membránové vesikuly a proteoliposomy) a v modelovém systému peptid-membrána. Tento model umožňuje doplnit poznatky získané funkčními testy informacemi o struktuře a sbalení transmembránových segmentů a eventuálně některými funkčními detaily. Očekává se, že získaná data povedou k objasnění translokační dráhy pro protony a dvojmocné ionty uvnitř MntH a k charakterizaci některých aspektů fylogenetické odlišnosti v rámci
Title	Biophysical study of MntH membrane transport proteins: structure-function relationship (en) Biofyzikální studie membránových transportních proteinů MntH: vztah struktury a funkce
skos:notation	GA204/07/0558
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F07%2F0558/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F07%2F0558/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-02-09 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	82299435
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	BO - Biofyzika
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	divalent metal ions; membrane transport; MntH; Nramp; secondary active membrane transport proteins (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Matematicko-fyzikální fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2010-04-16 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/204%2F07%2F0558
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2010
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2011
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02007GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2010-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Projekt byl zaměřen na studium bakteriálních transportérů dvojmocných kovových iontů z rodiny Nramp/MntH (SLC11) patřících mezi sekundárně aktivní membránové transportní proteiny závislé na protonovém gradientu. Projekt přispěl k objasnění vztahu struktury a funkce v rodině Nramp pomocí studia funkce klíčových reziduí/transmembránových segmentů, in vivo, in vitro a v modelovém syst (cs) This project aimed at bacterial H+-dependent secondary active membrane transporters of divalent metal ions (Me2+) from the Nramp/MntH (SLC11) family. It advanced knowledge of the structure-function relationship in the MntH/Nramp family by studying the function of key residues in vivo, in vitro and in a peptide-membrane model system. A new fluorescence method developed for measuring the stoichiome (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	MntH Nramp membrane transport divalent metal ions
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Solute carrier 11 cation symport requires distinct residues in transmembrane helices 1 and 6. Ion Channel Activity of Transmembrane Segment 3 of E. coli MntH in the Presence of Manganese Ion Channel Activity of Transmembrane Segment 6 of Escherichia coli Proton-Dependent Manganese Transporter
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F07%2F0558/2007/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F07%2F0558/2008/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F07%2F0558/2009/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F07%2F0558/2010/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F07%2F0558/2011/orjk%3A11320

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software