About: Modifications and bioorthogonal reactions in the major groove of DNA for regulation of protein binding and gene expression

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Modifications and bioorthogonal reactions in the major groove of DNA for regulation of protein binding and gene expression Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA14-04289S
Description	Syntéza nových oligonukleotidů (ON) a DNA s modifikovanými bázemi nesoucí různé modifikace ve velkém žlábku bude využita pro koncepčně nové aplikace v chemické biologii. Příprava modifikovaných nukleových kyselin bude založena na cross-coupling reakcích nukleosid trifosfátů následovaných inkorporacemi katalyzovanými DNA polymerasami. Různé typy modifikací budou studovány jako chránící skupiny pro regulaci (přepínání) vazby proteinů na DNA. Bude podrobně a systematicky studován vliv připojených funkčních nebo chránících skupin různé sterické náročnosti ve velkém žlábku DNA na sekvenčně-specifické interakce s proteiny (restrikční endonukleasy, methyltransferasy, transkripční faktory atd.) a na in vitro transkripci. Transformace těchto připojených skupin bioorthogonálními reakcemi bude využito pro regulaci a přepínání těchto interakcí a následných biologických procesů (zejména transkripce). Synthesis of novel base-modified oligonucleotides (ONs) and DNA bearing diverse modifications in major groove for conceptually novel applications in chemical biology will be pursued. The preparation of modified nucleic acids will be based on cross-coupling reactions of nucleoside triphosphates followed by enzymatic incorporation catalyzed by DNA polymerases. The diverse types of modifications will be studied as protecting groups for regulation (switching) of binding of proteins to DNA. The influence of an attachment of functional or protecting groups of variable bulkiness to the major groove of DNA on sequence-specific interactions with proteins (restriction endonucleases, methyltransferases, transcription factors etc.) and on in vitro transcription will be systematically studied. Transformations of these attached groups by bioorthogonal reactions will be used to regulate and switch these interactions and the corresponding biological processes (transcription). (en)
Title	Modifications and bioorthogonal reactions in the major groove of DNA for regulation of protein binding and gene expression (en) Modifikace a bioorthogonální reakce ve velkém žlábku DNA pro regulaci vazby proteinů a genové exprese
skos:notation	GA14-04289S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-04289S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-04289S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100788781
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	DNA, oligonucleotides, DNA polymerase, transcription, RNA polymerase, transcription factors, bioorthogonal reactions (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-04-23 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/14-04289S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201400001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CC - Organická chemie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2014-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	DNA DNA polymerase RNA polymerase oligonucleotides transcription transcription factors
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Synthesis of Base-Modified 2 '-Deoxyribonucleoside Triphosphates and Their Use in Enzymatic Synthesis of Modified DNA for Applications in Bioanalysis and Chemical Biology Polymerase Synthesis of Photocaged DNA Resistant against Cleavage by Restriction Endonucleases Polymerase Synthesis of DNAs Bearing Vinyl Groups in the Major Groove and their Cleavage by Restriction Endonucleases
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-04289S/2014/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-04289S/2014/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-04289S/2015/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-04289S/2015/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-04289S/2016/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-04289S/2016/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 41 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software