| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - The genus Acinetobacter is a ubiquitous group of physiologically and biochemically versatile bacteria. Despite the progress in the classification of acinetobacters from humans, very little is known about their diversity in the natural environment. To address this issue, we propose a project designed as an in-depth population genetic study based on a prospective collection of strains from different well-defined ecosystems. An approach based on MALDI-TOF MS profiling will be optimized to become a rapid and reliable tool for the identification of acinetobacters in primary culture. Strains of unknown taxonomic status will be also studied using multilocus sequence analysis, whole-genome comparison, and a wide range of phenotypic tests. The existing MALDI-TOF MS identification database will be continuously updated with reference entries from the taxonomic analysis of new isolates. The project is expected to improve essentially the knowledge of the Acinetobacter diversity and phylogeny at the species and strain levels and to provide a taxonomically precise basis for ecological studies. (en)
- Rod Acinetobacter zahrnuje fyziologicky a biochemicky heterogenní skupinu bakterií značně rozšířených v přírodě. I přes pokrok, kterého bylo dosaženo v klasifikaci humánních izolátů acinetobakterů, máme jen velmi málo informací o diverzitě tohoto rodu v přírodním prostředí. Navržený projekt je koncipován jako detailní populačně genetická studie založená na prospektivním sběru kmenů z různých, jasně definovaných ekosystémů. Za účelem efektivní identifikace acinetobakterů přímo z primokultur budou optimalizovány postupy založené na MALDI-TOF MS. Kmeny s neznámou taxonomickou pozicí budou též studovány pomocí multilokusové sekvenční analýzy, srovnávací analýzy kompletních genomů a detailní fenotypové analýzy. Na základě taxonomické analýzy nových izolátů bude stávající identifikační databáze MALDI-TOF MS průběžně aktualizována. Lze očekávat, že projekt zásadním způsobem přispěje k poznání diverzity a fylogeneze rodu Acinetobacter na druhové i poddruhové úrovni a k získání podrobných taxonomických poznatků, které budou východiskem pro další ekologické studie.
|
| Title
| - Genetic diversity and phylogeny of the genus Acinetobacter in natural ecosystems. (en)
- Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech.
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - Acinetobacter, biodiversity, taxonomy, phylogeny, genomics, antibiotic susceptibility, natural ecosystem (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - Acinetobacter
- antibiotic susceptibility
- biodiversity
- genomics
- phylogeny
- taxonomy
|
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)