About: Studium kódu CTD RNA polymerázy II

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Studium kódu CTD RNA polymerázy II Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-18344S
Description	I propose to decipher the basic rules that govern the readout of the CTD code of RNA polymerase II (RNAPII) by processing factors. The concept of the CTD code that specifies the position of RNAPII in the transcriptional cycle and thus recruits specific processing factors, was suggested almost a decade ago. Previous X-ray crystallography attempts to reveal the CTD structure and its interaction with multiple binding factors were unsuccessful due to flexibility of the CTD and its weak binding affinity to processing factors. We will determine the NMR structures of several processing factors bound to the CTD with various modification marks. Thanks to the recent development of SAXS that can be combined with a high resolution NMR structures of weak complexes, we will answer the long-standing question of how the overall CTD structure is modulated upon binding of processing factors. The use of this technology will provide entirely new structural information that will go significantly beyond the state of the art in the research fields of transcription and RNA processing. (en) Navrhuji objasnit základní pravidla, která používají RNA procesující faktory pro rozpoznávání tzv. CTD kódu RNA polymerázy II. Koncept CTD kódu, který určuje pozici RNA polymerázy v transkripčním cyklu a řídí interakce se specifickými procesujícími faktory byl navrhnut téměř před 10 lety. Snaha odhalit strukturu CTD a její interakce s četnými vazebnými faktory byla neúspěšná v předchozích krystalografických pokusech z důvodu flexibility CTD a její slabé vazebné afinitě k procesujícím faktorům. V tomto projektu určíme NMR struktury několika procesujících faktorů navázaných na CTD s různými modifikačními značkami. Nedávný vývoj v oblasti SAXS technik, které lze nyní kombinovat s vysoce rozlišenými NMR strukturami, nám umožní objasnit dlouhodobou otázku jak vazba procesujících faktorů mění strukturu CTD. Použití této technologie poskytne zcela nové strukturní informace k objasnění CTD kódu, což významně posune hranice poznání v oboru transkripce a procesování RNA.
Title	Studium kódu CTD RNA polymerázy II Towards the understanding of the CTD code of RNA Polymerase II (en)
skos:notation	GA13-18344S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-18344S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-18344S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100770480
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Protein-protein complexes; NMR spectroscopy; 3D structure; cotranscriptional processing; RNA polymerase II; CTD (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Středoevropský technologický institut
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-04-18 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-18344S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2017-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	3D structure NMR spectroscopy RNA polymerase II cotranscriptional processing Protein-protein complexes
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-18344S/2013/orjk%3A14740 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-18344S/2014/orjk%3A14740 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-18344S/2015/orjk%3A14740 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-18344S/2016/orjk%3A14740 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-18344S/2017/orjk%3A14740

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 81 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software