| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - The aim of the project is to develop a methodology for volume reconstruction, segmentation and stereological measurements of images captured by a confocal laser-scanning microscope from large biological tissue specimens using three-dimensional (3D) imaging, virtual reality and graphics processor unit (GPU) programming. We will develop a software system performing volume reconstruction taking into account specific features of captured data sets, which includes improvement of visual quality of images, merging images of horizontal fields of view and vertical merging of images of subsequent physical slices into a digital volume representation of the whole specimen. We will implement an elastic registration method for merging images of the subsequent physical slices. We will develop new algorithms for 3D segmentation taking advantages of visualization using real-time volume rendering and virtual reality. The algorithms will utilize image tensors with adequate modification of 3D-live-wire (en)
- Cílem projektu je vývoj metodiky pro objemovou rekonstrukci, segmentaci a stereologická měření obrazů získaných laserovým konfokálním mikroskopem z velkých biologických vzorků s využitím trojrozměrného (3D) zobrazování, virtuální reality a programování grafické procesorové jednotky (GPU). Vyvineme programové vybavení realizující objemovou rekonstrukci s ohledem na specifika konfokálních obrazů a daných biologických materiálů: Zaměříme se na zlepšení vizuální kvality obrazů v sériích, horizontální skládání zorných polí a vertikální skládání obrazů následných fyzických řezů ve výslednou digitální reprezentaci preparátu. Navrhneme metodu elastické registrace pro skládání objemů následných fyzických řezů. Vyvineme nové metody interaktivních 3D segmentačních algoritmů, těžících z možnosti zobrazování, jak pomocí objemového renderování, tak pomocí scény ve virtuální realitě. Algoritmy budou založeny na využití tenzorových obrazů s odpovídající úpravou metod 3D-live-wire a graph-cuts. Vyvineme
|
| Title
| - Visualization and processing of 3D images captured by a confocal microscope using graphics processor unit programming and virtual reality (en)
- Vizualizace a zpracování 3D obrazových dat z konfokálního mikroskopu s využitím programování grafické procesorové jednotky a virtuální reality
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - confocal microscopy; volume reconstruction; elastic registration; 3D segmentation; stereology; virtu (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - During the project we developed and published an original methodology for volume reconstruction from the confocal data of large biological specimens with correction of undesirable image distortions. This methodology was further extended by using a modern microscopic method - OPT (Optical Projection Tomography Microscopy). We performed six time-consuming volume reconstructions from mouse embryos. (en)
- Během projektu byla vyvinuta a publikována originální metodika pro objemovou rekonstrukci velkých biologických vzorků z konfokálních dat korigující nežádoucí deformace obrazů. Tato metodika byla rozšířena o využití moderní mikroskopické metody OPT (Optical Projection Tomography Microscopy). Bylo realizováno šest časově náročných objemových rekonstrukcí z myších embryí. Implementovali jsme uživate (cs)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - confocal microscopy
- 3D segmentation
- elastic registration
- stereology
- volume reconstruction
|
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)