Desipramin je marker aktivity izoenzymu CYP2D6. Klinicky relevantní interakce se mohou vyskytnout s jinými substráty CYP 2D6 s úzkým terapeutickým indexem jako je třída antiarytmik 1C, do níž patří propafenon a flekainid, TCA a typická antipsychotika, zejména při vyšších dávkách sertralinu. (cs)