Projekt si klade za cíl popsat změny v genové expresi, které se odehrávají na straně patogena (komplexu Burkholderia cepacia, Bcc) v průběhu postupného zhoršování klinického stavu pacientů s cystickou fibrózou. Pomocí technologie DNA čipů bude vyšetřen a srovnán transkriptom Bcc (3 druhů) generovaný za podmínek růstu ve sputu a v séru, které byly odebrány od pacientů ve fázi klinicky stabilní infekce, exacerbace a cepacia syndromu. Každou podmínku budou reprezentovat alespoň tři biologické replikáty. Vybrané geny kódující pravděpodobné faktory patogenity (odhadem 6-8) budou testovány pro možnost praktického využití jako markerů monitorování stavu infekce na dalších vzorcích klinického materiálu. (cs)
The aim of the project is to describe changes in gene expression of the pathogen (Burkholderia cepacia complex, Bcc) during the course of the infection in patients with cystic fibrosis. By using DNA chip technology we wil examine and compare transcriptome of the Bcc(3 different species) generated during the growth in sputum or serum that were taken from patients at the stage of clinically stable infection, exacerbation and cepacia syndrome. Each condition will be represented by three biological replicates. Selected genes encoding probable factors of pathogenicity (ca. 6-8) will be tested for their potential use as markers of monitoring the infection status on more clinical samples. (en)