This HTML5 document contains 49 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n19http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n7http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n21http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-26526S/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n18http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n16http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GA13-26526S
rdf:type
n7:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-26526S
dcterms:description
Project is aimed at the synthesis of structurally diverse, isopolar phosphonate oligonucleotides (ONs) with the nuclease-stable, phosphonate-type internucleotide linkage as potential (i) tools for gene expression regulation (antisense ONs, siRNAs), (ii) agonists/antagonists of TLR9 receptor (CpG motif-containing ONs), and (iii) effectors of 2-5A system - agonists/antagonists of RNase L (2',5'-oligoriboadenylates) and inhibitors of the 2',5'-specific phosphodiesterase. A key part of the project is the synthesis of monomers which, upon incorporation into DNA and RNA ONs, give rise to the formation of so far unexplored phosphonothioate, phosphonoamidate, and phosphonothioamidate internucleotide linkages. Biological effects of synthesized ONs will be tested in vitro on recombinant enzymes, cell cultures, and animal models. Interactions of ONs on molecular level will be studied by spectroscopic and theoretical methods and the obtained knowledge will be correlated with those obtained on biological activity of new ONs with the aim to understand more deeply structure-activity relationships. Projekt je zaměřen na syntézu strukturně diverzifikovaných izopolárních analogů oligonukleotidů (ON) s nukleázově stabilní internukleotidovou vazbou fosfonátového typu jako možných (i) nástrojů k ovlivnění exprese genomu (antisensní ON a siRNA), (ii) agonistů/antagonistů receptoru TLR9 (ON s CpG motivem) a (iii) efektorů tzv. 2-5A dráhy - agonistů/antagonistů RNasy L (2',5'-oligoriboadenyláty) a inhibitorů 2',5'-specifické fosfodiesterasy. Zásadní součástí projektu je syntéza monomerů – nukleosid-2'(3')- a 5'-fosfonátů/fosfinátů, jejichž inkorporace do DNA a RNA oligomerů, vede ke vzniku izosterních a neizosterních fosfonothioátových, fosfonoamidátových a fosfonothioamidátových internukleotidových vazeb, které nebyly dosud v ON studovány. Účinky připravených ON budou testovány in vitro na rekombinantních enzymech, tkáňových kulturách a na zvířecích modelech. Interakce ON budou studovány na molekulární úrovni spektrálními a teoretickými metodami a nové poznatky budou korelovány s biologickou aktivitou nových ON s cílem vědět více o vztazích mezi strukturou a biologickou aktivitou.
dcterms:title
Novel DNA and RNA oligonucleotides with Phosphonothioate and Phosphonoamidate Internucleotide Linkages. Nové DNA a RNA oligonukleotidy s fosfonothioátovými a fosfonoamidátovými internukleotidovými vazbami
skos:notation
GA13-26526S
n3:aktivita
n18:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n21:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n21:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2015-04-23+02:00
n3:druhSouteze
n17:VS
n3:duvernostUdaju
n20:S
n3:fazeProjektu
n12:100770780
n3:hlavniObor
n8:CC
n3:kategorie
n10:ZV
n3:klicovaSlova
oligonucleotides; phosphonates; phosphonoamidites, phosphonoamidates; phosphonothioates; H-phosphinates; nucleotides; monomers; solid phase synthesis; RNase H; RNase L; 2',5'-specific phosphodiesterase; 2-5A; CpG motif; siRNA; antisense
n3:partnetrHlavni
n19:ico%3A61388963
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
1
n3:pocetVysledkuRIV
6
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
6
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-04-18+02:00
n3:prideleniPodpory
n13:13-26526S
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n16:2015
n3:sberDatUdajeProjZameru
n16:2015
n3:soutez
n15:SGA0201300005
n3:statusZobrazovaneFaze
n9:DRRVB
n3:typPojektu
n5:P
n3:ukonceniReseni
2016-12-31+01:00
n3:zahajeniReseni
2013-02-01+01:00
n3:zivotniCyklusProjektu
n11:ZBB
n3:klicoveSlovo
oligonucleotides 5'-specific phosphodiesterase H-phosphinates monomers siRNA 2' nucleotides RNase H solid phase synthesis 2-5A RNase L phosphonates CpG motif phosphonoamidates phosphonoamidites phosphonothioates