This HTML5 document contains 40 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/zivotniCyklusProjektu/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/typPojektu/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/druhSouteze/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/subjekt/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/kategorie/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/duvernostUdaju/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/fazeProjektu/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/obor/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/soutez/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/statusZobrazovaneFaze/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n18http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-10799S/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/cep/
n21http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/aktivita/
n4http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:GA13-10799S
rdf:type
n8:Projekt
rdfs:seeAlso
http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-10799S
dcterms:description
Optické vlastnosti fluorescentních proteinů (FP) jsou anisotropické, čehož lze využít při vývoji a použití řady geneticky kódovaných fluorescentních sond biologických procesů. Anisotropie FP však také může (prostřednictvím polarizační mikroskopie) poskytovat informace o struktuře proteinů, přímo v živých buňkách. Tato možnost je však v současnosti neprozkoumána. Navrhujeme proto tuto mezeru zaplnit otestováním hypotézy, že polarizační mikroskopii lze využít k určení orientace FP vůči jiným částem fúzního proteinu. Abychom toho dosáhli, tak 1) určíme orientaci dipólových momentů přechodu (DMP) vůči buněčné membráně u membránových proteinů značených pomocí FP; 2) určíme směr DMP v molekulách významných FP; 3) určíme orientaci FP v konstruktech na bázi membránových proteinů a porovnáme ji s dostupnými strukturními daty. Naše výsledky poskytnou základní informace o fluorescentních proteinech, umožní zlepšení současných geneticky kódovaných fluorescentních sond, a přispějí k vývoji nových nástrojů pro získávání strukturních informací o proteinech. Optical properties of fluorescent proteins (FPs) are anisotropic. This fact can be used to develop a broad range of genetically encoded probes of biological processes. In principle, FP anisotropy (through polarization microscopy) can also provide information about protein structure, in living cells. This possibility, however, remains unexplored. We want to fill this gap by testing the hypothesis that polarization microscopy can be used to determine the orientation of an FP with respect to other parts of a fusion protein. In order to achieve this goal, we will: 1) determine orientation of transition dipole moments (TDMs) with respect to the cell membrane in FP-labeled membrane proteins; 2) determine TDM direction in molecules of representative FPs; and 3) determine orientation of the FP moiety in several membrane protein constructs and compare the results with available structural data. The results will provide fundamental information about FPs, allow improvements in genetically encoded fluorescent probes, and yield new tools for obtaining protein structure information.
dcterms:title
Insights into protein structure from polarization fluorescence microscopy Výzkum struktury proteinů prostřednictvím polarizační fluorescenční mikroskopie
skos:notation
GA13-10799S
n3:aktivita
n21:GA
n3:celkovaStatniPodpora
n18:celkovaStatniPodpora
n3:celkoveNaklady
n18:celkoveNaklady
n3:datumDodatniDoRIV
2015-04-23+02:00
n3:druhSouteze
n12:VS
n3:duvernostUdaju
n6:S
n3:fazeProjektu
n10:100770076
n3:hlavniObor
n9:BO
n3:kategorie
n5:ZV
n3:klicovaSlova
fluorescent protein, linear dichroism, transition dipole moment, polarization microscopy, membrane protein structure, FRET
n3:partnetrHlavni
n7:ico%3A67179843
n3:pocetKoordinujicichPrijemcu
0
n3:pocetPrijemcu
1
n3:pocetSpoluPrijemcu
0
n3:pocetVysledkuRIV
1
n3:pocetZverejnenychVysledkuVRIV
1
n3:posledniUvolneniVMinulemRoce
2014-03-31+02:00
n3:prideleniPodpory
n13:13-10799S
n3:sberDatUcastniciPoslednihoRoku
n4:2015
n3:sberDatUdajeProjZameru
n4:2015
n3:soutez
n17:SGA0201300005
n3:statusZobrazovaneFaze
n15:DRRVB
n3:typPojektu
n16:P
n3:ukonceniReseni
2016-12-31+01:00
n3:vedlejsiObor
n9:ED n9:CE
n3:zahajeniReseni
2013-02-01+01:00
n3:zivotniCyklusProjektu
n14:ZBB
n3:klicoveSlovo
fluorescent protein polarization microscopy membrane protein structure transition dipole moment linear dichroism