This HTML5 document contains 42 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F68081766%3A_____%2F05%3A00000406%21RIV%2F2005%2FAV0%2FA67005%2FN/
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n4http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F68081766%3A_____%2F05%3A00000406%21RIV%2F2005%2FAV0%2FA67005%2FN
rdf:type
n13:Vysledek skos:Concept
dcterms:description
Kapilární elektroforéza SSCP je nová metoda studující polymorfismus DNA sekvencí zejména v populačně-genetických studiích. V práci je popisována optimalizace této metody při studiu polymorfismu genu DQA, který náleží mezi MHC geny skupiny II. Ideální podmínky kapilární elektroforézy, které umožnily odlišení téměř všech alel byly následující: SLPA jako dělící polymer, TrisCl (pH 8,5) jako pufr pro ředění vzorku a 27°C a 9 kV jako parametry elektroforézy. Zároveň jsme zjistili, že téměř 25% všech analyzovaných klonů obsahovalo PCR artefakt, proto by při analýzách MHC variability měla být uplatňována striktní kriteria pro identifikaci nových alel. Analysis of a single strand conformation polymorphism (SSCP) using capillary electrophoresis (CE) is a novel method to study polymorphism of DNA sequences in large scale population studies. We optimized CE-SSCP analysis to study the major histocompatibility complex (MHC) class II alpha gene (DQA) polymorphism. Short-chain linear polyacrylamide (6%) as sieving matrix, TrisCl (pH 8.5) as buffer for sample dilution, and 27 degrees C, 9 kV as electrophoresis parameters were suitable for sufficient resolution of all alleles. We found that almost 25% of clones contained a PCR (polymerase chain reaction) artefact and strict criteria have to be applied when using cloning and sequencing to analyse the allelic diversity of MHC genes. Analysis of a single strand conformation polymorphism (SSCP) using capillary electrophoresis (CE) is a novel method to study polymorphism of DNA sequences in large scale population studies. We optimized CE-SSCP analysis to study the major histocompatibility complex (MHC) class II alpha gene (DQA) polymorphism. Short-chain linear polyacrylamide (6%) as sieving matrix, TrisCl (pH 8.5) as buffer for sample dilution, and 27 degrees C, 9 kV as electrophoresis parameters were suitable for sufficient resolution of all alleles. We found that almost 25% of clones contained a PCR (polymerase chain reaction) artefact and strict criteria have to be applied when using cloning and sequencing to analyse the allelic diversity of MHC genes.
dcterms:title
Analysis of major histocompatibility complex class II gene in water voles using capillary electrophoresis-single stranded conformation polymorphism Analysis of major histocompatibility complex class II gene in water voles using capillary electrophoresis-single stranded conformation polymorphism Analýza genu hlavního histokompatibilního komplexu třídy II u hryzce vodního použitím analýzy SSCP v kapiláře
skos:prefLabel
Analysis of major histocompatibility complex class II gene in water voles using capillary electrophoresis-single stranded conformation polymorphism Analysis of major histocompatibility complex class II gene in water voles using capillary electrophoresis-single stranded conformation polymorphism Analýza genu hlavního histokompatibilního komplexu třídy II u hryzce vodního použitím analýzy SSCP v kapiláře
skos:notation
RIV/68081766:_____/05:00000406!RIV/2005/AV0/A67005/N
n3:strany
173;176
n3:aktivita
n12:Z
n3:aktivity
Z(AV0Z6093917)
n3:cisloPeriodika
1
n3:dodaniDat
n4:2005
n3:domaciTvurceVysledku
n16:1659758
n3:druhVysledku
n15:J
n3:duvernostUdaju
n14:S
n3:entitaPredkladatele
n8:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
512070
n3:idVysledku
RIV/68081766:_____/05:00000406
n3:jazykVysledku
n9:eng
n3:klicovaSlova
water vole;population genetics
n3:klicoveSlovo
n11:population%20genetics n11:water%20vole
n3:kodStatuVydavatele
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
n3:kontrolniKodProRIV
[4DA37311B11B]
n3:nazevZdroje
Molecular ecology notes
n3:obor
n17:EB
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
1
n3:pocetTvurcuVysledku
4
n3:rokUplatneniVysledku
n4:2005
n3:svazekPeriodika
5
n3:tvurceVysledku
Galan, M. Bryja, Josef Charbonnel, N. Cosson, J.-F.
n3:zamer
n10:AV0Z6093917
s:issn
1471-8278
s:numberOfPages
4