This HTML5 document contains 45 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
shttp://schema.org/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F68081707%3A_____%2F06%3A00039033%21RIV07-AV0-68081707/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n8http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F68081707%3A_____%2F06%3A00039033%21RIV07-AV0-68081707
rdf:type
n15:Vysledek skos:Concept
dcterms:description
Explicit solvent molecular dynamics simulations (MD) were carried out for sarcin-ricin domain (SRD) motifs from 23S (E. coli) and 28S (rat) rRNAs. Detailed analysis of the overall dynamics, base pairing, hydration, cation binding and other SRD features is presented. In summary, SRD is an unusual stiff rRNA building block. Its intrinsic structural and dynamical signatures seen in MD are strikingly distinct from other rRNA motifs such as Loop E and Kink-turns. Explicit solvent molecular dynamics simulations (MD) were carried out for sarcin-ricin domain (SRD) motifs from 23S (E. coli) and 28S (rat) rRNAs. Detailed analysis of the overall dynamics, base pairing, hydration, cation binding and other SRD features is presented. In summary, SRD is an unusual stiff rRNA building block. Its intrinsic structural and dynamical signatures seen in MD are strikingly distinct from other rRNA motifs such as Loop E and Kink-turns. Molekulárně dynamické (MD) simulace se zahrnutím explicitního solventu byli uskutečněné na sarcin-ricin motivech (SRD) z 23S (E. coli) a 28S (potkan) rRNA. Detailní analýza celkové dynamiky, párování, hydratace, vázání kationů a jiných SRD specifik je v této práci prezentovaná. Celkem, SRD je neobyčejně tuhý rRNA stavební blok. Jeho vnitřní (individuálně) strukturní a dynamické vlastnosti pozorované v MD jsou úplně odlišné od jiných rRNA motivů jako např. Loop E a Kink-turn.
dcterms:title
Molecular dynamics simulations of sarcin-ricin rRNA motif Molecular dynamics simulations of sarcin-ricin rRNA motif Molekulárně dynamické simulace sarcin-ricin rRNA motivů
skos:prefLabel
Molekulárně dynamické simulace sarcin-ricin rRNA motivů Molecular dynamics simulations of sarcin-ricin rRNA motif Molecular dynamics simulations of sarcin-ricin rRNA motif
skos:notation
RIV/68081707:_____/06:00039033!RIV07-AV0-68081707
n4:strany
697;708
n4:aktivita
n6:Z n6:P
n4:aktivity
P(GA203/05/0009), P(GA203/05/0388), P(LC512), Z(AV0Z50040507)
n4:cisloPeriodika
2
n4:dodaniDat
n8:2007
n4:domaciTvurceVysledku
n10:7167830 n10:3223779
n4:druhVysledku
n12:J
n4:duvernostUdaju
n18:S
n4:entitaPredkladatele
n7:predkladatel
n4:idSjednocenehoVysledku
486609
n4:idVysledku
RIV/68081707:_____/06:00039033
n4:jazykVysledku
n14:eng
n4:klicovaSlova
sarcin-ricin domain; molecular dynamics
n4:klicoveSlovo
n13:molecular%20dynamics n13:sarcin-ricin%20domain
n4:kodStatuVydavatele
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
n4:kontrolniKodProRIV
[AB208080A04A]
n4:nazevZdroje
Nucleic Acids Research
n4:obor
n11:BO
n4:pocetDomacichTvurcuVysledku
2
n4:pocetTvurcuVysledku
2
n4:projekt
n5:LC512 n5:GA203%2F05%2F0009 n5:GA203%2F05%2F0388
n4:rokUplatneniVysledku
n8:2006
n4:svazekPeriodika
34
n4:tvurceVysledku
Šponer, Jiří Špačková, Naděžda
n4:zamer
n17:AV0Z50040507
s:issn
0305-1048
s:numberOfPages
12