This HTML5 document contains 58 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F61389030%3A_____%2F08%3A00322569%21RIV09-AV0-61389030/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n4http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n7http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F61389030%3A_____%2F08%3A00322569%21RIV09-AV0-61389030
rdf:type
skos:Concept n12:Vysledek
dcterms:description
Průtoková cytometrie umožňuje třídění chromozómů, které mohou být využity při analýze genomu. Získání mikrogramových množství DNA vyžaduje vytřídění miliónů chromozómů, což je pracné a časově náročné. Mnoho genomických aplikací, jako je vývoj genetických map nebo fyzické mapování, však nevyžaduje dlouhé fragmenty DNA. V takových případech může být doba třídění minimalizovaná využitím celogenomové amplifikace. V této práci je popsán protokol pro amplifikaci DNA z deseti tisíc chromozómů ječmene, které mohou být vytříděny za méně než jednu hodinu. Srování přítomnosti SNP markerů v amplifikované a neamplikované DNA potvrdilo vysokou reprezentativnost amplifikace. Tato metoda podstatně rozšiřuje možnosti využití tříděných chromozómů v genomice rostlin. Background: Flow cytometry facilitates sorting of single chromosomes and chromosome arms which can be used for targeted genome analysis. However, the recovery of microgram amounts of DNA needed for some assays requires sorting of millions of chromosomes which is laborious and time consuming. Yet, many genomic applications such as development of genetic maps or physical mapping do not require large DNA fragments. In such cases time-consuming de novo sorting can be minimized by utilizing whole-genome amplification. Results: Here we report a protocol optimized in barley including amplification of DNA from only ten thousand chromosomes, which can be isolated in less than one hour. Flow-sorted chromosomes were treated with proteinase K and amplified using Phi29 multiple displacement amplification (MDA). Overnight amplification in a 20-microlitre reaction produced 3.7 – 5.7 micrograms DNA with a majority of products between 5 and 30 kb. To determine the purity of sorted fractions and potential amplifica... Background: Flow cytometry facilitates sorting of single chromosomes and chromosome arms which can be used for targeted genome analysis. However, the recovery of microgram amounts of DNA needed for some assays requires sorting of millions of chromosomes which is laborious and time consuming. Yet, many genomic applications such as development of genetic maps or physical mapping do not require large DNA fragments. In such cases time-consuming de novo sorting can be minimized by utilizing whole-genome amplification. Results: Here we report a protocol optimized in barley including amplification of DNA from only ten thousand chromosomes, which can be isolated in less than one hour. Flow-sorted chromosomes were treated with proteinase K and amplified using Phi29 multiple displacement amplification (MDA). Overnight amplification in a 20-microlitre reaction produced 3.7 – 5.7 micrograms DNA with a majority of products between 5 and 30 kb. To determine the purity of sorted fractions and potential amplifica...
dcterms:title
Coupling amplified DNA from flow-sorted chromosomes to high-density SNP mapping in barley Využití DNA amplifikované z tříděných chromozómů pro mapování SNA markerů u ječmene Coupling amplified DNA from flow-sorted chromosomes to high-density SNP mapping in barley
skos:prefLabel
Coupling amplified DNA from flow-sorted chromosomes to high-density SNP mapping in barley Využití DNA amplifikované z tříděných chromozómů pro mapování SNA markerů u ječmene Coupling amplified DNA from flow-sorted chromosomes to high-density SNP mapping in barley
skos:notation
RIV/61389030:_____/08:00322569!RIV09-AV0-61389030
n3:aktivita
n11:Z n11:P
n3:aktivity
P(GD521/05/H013), P(LC06004), P(ME 884), Z(AV0Z50380511)
n3:cisloPeriodika
294
n3:dodaniDat
n7:2009
n3:domaciTvurceVysledku
n4:3817016 n4:6390471 n4:3278913 n4:5207010 n4:1800477 n4:8657572
n3:druhVysledku
n16:J
n3:duvernostUdaju
n13:S
n3:entitaPredkladatele
n14:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
361462
n3:idVysledku
RIV/61389030:_____/08:00322569
n3:jazykVysledku
n6:eng
n3:klicovaSlova
Flow cytometry; DNA amplification; Hordeum vulgare L.
n3:klicoveSlovo
n9:Flow%20cytometry n9:DNA%20amplification n9:Hordeum%20vulgare%20L.
n3:kodStatuVydavatele
US - Spojené státy americké
n3:kontrolniKodProRIV
[0AA6D4A8F927]
n3:nazevZdroje
B M C Genomics
n3:obor
n18:EB
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
6
n3:pocetTvurcuVysledku
10
n3:projekt
n15:ME%20884 n15:GD521%2F05%2FH013 n15:LC06004
n3:rokUplatneniVysledku
n7:2008
n3:svazekPeriodika
9
n3:tvurceVysledku
Hřibová, Eva Bhat, P. R. Doležel, Jaroslav Šafář, Jan Šimková, Hana Condamine, P. Bartoš, Jan Svensson, J. T. Suchánková, Pavla Close, T. J.
n3:wos
000257741700001
n3:zamer
n17:AV0Z50380511
s:issn
1471-2164
s:numberOfPages
9