This HTML5 document contains 46 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n9http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F61388963%3A_____%2F08%3A00315423%21RIV09-AV0-61388963/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n13http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F61388963%3A_____%2F08%3A00315423%21RIV09-AV0-61388963
rdf:type
skos:Concept n16:Vysledek
dcterms:description
Virtuální testování léčiv se stalo důležitým nástrojem pro racionální návrh léčiv. Nicméně jeho použití je limitováno přesnou skórovací funkcí. V předkládané studii prezentujeme novou funkci, MedusaScore, k určení affinity protein-ligand. MedusaScore je založena na principu fyzikálně modelované interakce která zahruje van der Waalsovské, solvatační a elektrostatické příspěvky. Virtual screening is becoming an important tool for drug discovery. However, the application of virtual screening has been limited by the lack of accurate scoring functions. Here, we present a novel scoring function, MedusaScore, for evaluating protein-ligand binding. MedusaScore is based on models of physical interactions that include van der Waals, solvation, and hydrogen bonding energies. To ensure the best transferability of the scoring function, we do not use any protein-ligand experimental data for parameter training. Virtual screening is becoming an important tool for drug discovery. However, the application of virtual screening has been limited by the lack of accurate scoring functions. Here, we present a novel scoring function, MedusaScore, for evaluating protein-ligand binding. MedusaScore is based on models of physical interactions that include van der Waals, solvation, and hydrogen bonding energies. To ensure the best transferability of the scoring function, we do not use any protein-ligand experimental data for parameter training.
dcterms:title
MedusaScore: An accurate force field-based scoring function for virtual drug screening MedusaScore: An accurate force field-based scoring function for virtual drug screening MedusaScore: Přesná skórovací funkce na bázi empirického potenciálu pro virtuální návrh léčiv
skos:prefLabel
MedusaScore: Přesná skórovací funkce na bázi empirického potenciálu pro virtuální návrh léčiv MedusaScore: An accurate force field-based scoring function for virtual drug screening MedusaScore: An accurate force field-based scoring function for virtual drug screening
skos:notation
RIV/61388963:_____/08:00315423!RIV09-AV0-61388963
n3:aktivita
n4:Z
n3:aktivity
Z(AV0Z40550506)
n3:cisloPeriodika
8
n3:dodaniDat
n13:2009
n3:domaciTvurceVysledku
n9:2785056 n9:7358946
n3:druhVysledku
n14:J
n3:duvernostUdaju
n15:S
n3:entitaPredkladatele
n17:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
378376
n3:idVysledku
RIV/61388963:_____/08:00315423
n3:jazykVysledku
n8:eng
n3:klicovaSlova
free-energy calculation; protein-ligand complex; binding-affinity; flexible docking; molecular recognition
n3:klicoveSlovo
n5:protein-ligand%20complex n5:molecular%20recognition n5:flexible%20docking n5:free-energy%20calculation n5:binding-affinity
n3:kodStatuVydavatele
US - Spojené státy americké
n3:kontrolniKodProRIV
[816193797264]
n3:nazevZdroje
Journal of Chemical Information and Modeling
n3:obor
n10:CF
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
2
n3:pocetTvurcuVysledku
4
n3:rokUplatneniVysledku
n13:2008
n3:svazekPeriodika
48
n3:tvurceVysledku
Dokholyan, N. V. Bendová, Lada Yin, S. Vondrášek, Jiří
n3:wos
000258697400010
n3:zamer
n11:AV0Z40550506
s:issn
1549-9596
s:numberOfPages
7