This HTML5 document contains 45 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n14http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F61388963%3A_____%2F07%3A00090252%21RIV08-AV0-61388963/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n11http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F61388963%3A_____%2F07%3A00090252%21RIV08-AV0-61388963
rdf:type
skos:Concept n9:Vysledek
dcterms:description
Volná energie disociace duplexu DNA, získaná experimentálně, byla srovnána s párovými interakčními energiemi bází DNA a jejich solvatační volnou energií. Interakční energie byly počítány nedávno vyvinutou metodou RI-DFT-D, solvatace pomocí dielektrického modelu C-PCM. Bylo otestováno několik modelů korelujících experimentální volné energie disociace duplexu s vypočtenými energiemi. Model zahrnující všechny spočtené příspěvky je schopen velice dobře předpovídat stabilitu DNA. Rozbor výsledků navíc ukazuje relativní důležitost jednotlivých příspěvků ke stabilitě struktury DNA a ukazuje zásadní roli patrových disperzních interakcí. Experimental unwinding free energy of 128 DNA octamers was correlated with the sum of interaction energies among DNA bases and their solvation energies. The former energies were determined with the recently developed RI-DFT-D procedure. The solvation energy was determined using a C-PCM continuum solvent at HF level calculations. Various models were adopted to correlate theoretical energies with experimental unwinding free energies. The most advanced model yielded very close correlation. Analysis of the theoretical results has shown the importance of inter- and intramolecular stacking energies, and especially the latter term plays a key role in determining the DNA duplex stabilization. Experimental unwinding free energy of 128 DNA octamers was correlated with the sum of interaction energies among DNA bases and their solvation energies. The former energies were determined with the recently developed RI-DFT-D procedure. The solvation energy was determined using a C-PCM continuum solvent at HF level calculations. Various models were adopted to correlate theoretical energies with experimental unwinding free energies. The most advanced model yielded very close correlation. Analysis of the theoretical results has shown the importance of inter- and intramolecular stacking energies, and especially the latter term plays a key role in determining the DNA duplex stabilization.
dcterms:title
On the nature of DNA - duplex stability On the nature of DNA - duplex stability O povaze stability dvojšroubovice DNA
skos:prefLabel
O povaze stability dvojšroubovice DNA On the nature of DNA - duplex stability On the nature of DNA - duplex stability
skos:notation
RIV/61388963:_____/07:00090252!RIV08-AV0-61388963
n3:strany
2983;2989
n3:aktivita
n16:Z n16:P
n3:aktivity
P(GA203/05/0009), P(LC512), Z(AV0Z40550506)
n3:cisloPeriodika
10
n3:dodaniDat
n11:2008
n3:domaciTvurceVysledku
n12:2932016 n12:5993768
n3:druhVysledku
n18:J
n3:duvernostUdaju
n17:S
n3:entitaPredkladatele
n14:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
439401
n3:idVysledku
RIV/61388963:_____/07:00090252
n3:jazykVysledku
n10:eng
n3:klicovaSlova
DNA stability; density functional calculations; dispersion interaction
n3:klicoveSlovo
n8:dispersion%20interaction n8:density%20functional%20calculations n8:DNA%20stability
n3:kodStatuVydavatele
DE - Spolková republika Německo
n3:kontrolniKodProRIV
[53BE8A4AE206]
n3:nazevZdroje
Chemistry - A European Journal
n3:obor
n5:CF
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
2
n3:pocetTvurcuVysledku
2
n3:projekt
n6:LC512 n6:GA203%2F05%2F0009
n3:rokUplatneniVysledku
n11:2007
n3:svazekPeriodika
13
n3:tvurceVysledku
Hobza, Pavel Řezáč, Jan
n3:zamer
n13:AV0Z40550506
s:issn
0947-6539
s:numberOfPages
7