This HTML5 document contains 44 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n9http://localhost/temp/predkladatel/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
n18http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F60461373%3A22340%2F09%3A43893880%21RIV13-MSM-22340___/
shttp://schema.org/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n6http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F60461373%3A22340%2F09%3A43893880%21RIV13-MSM-22340___
rdf:type
n14:Vysledek skos:Concept
dcterms:description
Poly-gama-benzyl-L-glutamate (PBLG) is a synthetically prepared polypeptide soluble in many solvents. It may have many conformational and aggregation states in dependence on the acidity and polarity of the solvent. Because of this, PBLG was used in the past as a model compound to study behaviour of similar polypeptides. The aim of this work is to verify if the vibrational circular dichroism method is suitable for the study of different aggregation and conformational states. The most stable conformation of PBLG in most of the solvents (e.g. CHCl3) is the right handed alfa-helix. The polyproline II conformation was observed in the acidic solvent trifluoroacetic acid (TFA). We also observed the properties of PBLG in the mixed solvent system CDCl3 and TFA for different ratios of the components. PBLG is also known for the formation of the cholesteric liquid crystals in the solvents which support its aggregation. This type of crystals has a very strong VCD signal. That is why we studied PBLG in benzene solution. We used nitrobenzene, in which the aggregation does not occur, to differentiate the signals coming from the interaction of the benzene rings of PBLG with the solvent from the signals caused by the aggregation. Poly-gama-benzyl-L-glutamát ( PBLG ) je synteticky připravovaný polypeptid rozpustný v mnoha organických rozpouštědlech. Vykazuje řadu konformací a typů agregace v závislosti na polaritě a aciditě rozpouštědla. V minulosti byl mnohokrát využit jako modelová látka pro studium chování tohoto typu polypeptidů metodou vibračního cirkulárního dichroismu i jinými metodami. Cílem této práce je ověřit, zda je metoda VCD vhodná pro rozpoznávání jednotlivých druhů agregace a typů konformace. Nejstabilnější konformací, kterou PBLG zaujímá ve většině rozpouštědel je pravotočivá alfa-helix ( např.: v trichlormethanu ). V kyselém rozpouštědle ( trifluoroctová kyselina - TFA ) však byla pozorována i forma polyprolin II. Sledováno bylo i chování PBLG ve směsném rozpouštědle CDCl3 a TFA s různým zastoupením obou složek. PBLG je také zajímavý tvorbou kapalných krystalů cholesterického typu v rozpouštědlech, ve kterých velmi silně agreguje. Tento typ krystalů vykazuje velmi silný signál ve VCD. Z tohoto důvodu byla změřena spektra PBLG v benzenu. Pro odlišení signálů způsobených interakcí benzenových jader PBLG a rozpouštědla a signálů způsobených agregací, bylo využito roztoku PBLG v nitrobenzenu, v němž nedochází k agregaci. Poly-gama-benzyl-L-glutamát ( PBLG ) je synteticky připravovaný polypeptid rozpustný v mnoha organických rozpouštědlech. Vykazuje řadu konformací a typů agregace v závislosti na polaritě a aciditě rozpouštědla. V minulosti byl mnohokrát využit jako modelová látka pro studium chování tohoto typu polypeptidů metodou vibračního cirkulárního dichroismu i jinými metodami. Cílem této práce je ověřit, zda je metoda VCD vhodná pro rozpoznávání jednotlivých druhů agregace a typů konformace. Nejstabilnější konformací, kterou PBLG zaujímá ve většině rozpouštědel je pravotočivá alfa-helix ( např.: v trichlormethanu ). V kyselém rozpouštědle ( trifluoroctová kyselina - TFA ) však byla pozorována i forma polyprolin II. Sledováno bylo i chování PBLG ve směsném rozpouštědle CDCl3 a TFA s různým zastoupením obou složek. PBLG je také zajímavý tvorbou kapalných krystalů cholesterického typu v rozpouštědlech, ve kterých velmi silně agreguje. Tento typ krystalů vykazuje velmi silný signál ve VCD. Z tohoto důvodu byla změřena spektra PBLG v benzenu. Pro odlišení signálů způsobených interakcí benzenových jader PBLG a rozpouštědla a signálů způsobených agregací, bylo využito roztoku PBLG v nitrobenzenu, v němž nedochází k agregaci.
dcterms:title
Conformational study of poly(gama-benzyl-L-glutamate) by vibrational circular dichroism KONFORMAČNÍ STUDIE POLY-gama-BENZYL-L-GLUTAMÁTU METODOU VIBRAČNÍHO CIRKULÁRNÍHO DICHROISMU KONFORMAČNÍ STUDIE POLY-gama-BENZYL-L-GLUTAMÁTU METODOU VIBRAČNÍHO CIRKULÁRNÍHO DICHROISMU
skos:prefLabel
KONFORMAČNÍ STUDIE POLY-gama-BENZYL-L-GLUTAMÁTU METODOU VIBRAČNÍHO CIRKULÁRNÍHO DICHROISMU KONFORMAČNÍ STUDIE POLY-gama-BENZYL-L-GLUTAMÁTU METODOU VIBRAČNÍHO CIRKULÁRNÍHO DICHROISMU Conformational study of poly(gama-benzyl-L-glutamate) by vibrational circular dichroism
skos:notation
RIV/60461373:22340/09:43893880!RIV13-MSM-22340___
n5:aktivita
n16:Z
n5:aktivity
Z(MSM6046137307)
n5:cisloPeriodika
s2
n5:dodaniDat
n6:2013
n5:domaciTvurceVysledku
n7:6564844 n7:2179334
n5:druhVysledku
n17:J
n5:duvernostUdaju
n15:S
n5:entitaPredkladatele
n18:predkladatel
n5:idSjednocenehoVysledku
322357
n5:idVysledku
RIV/60461373:22340/09:43893880
n5:jazykVysledku
n12:cze
n5:klicovaSlova
liquid crystals; vibrational circular dichroism; aggregation; conformation; Poly-gama-benzyl-L-glutamate
n5:klicoveSlovo
n8:vibrational%20circular%20dichroism n8:conformation n8:liquid%20crystals n8:Poly-gama-benzyl-L-glutamate n8:aggregation
n5:kodStatuVydavatele
CZ - Česká republika
n5:kontrolniKodProRIV
[E9BDF3D51D7C]
n5:nazevZdroje
Chemické listy (special issue 13-14)
n5:obor
n11:CB
n5:pocetDomacichTvurcuVysledku
2
n5:pocetTvurcuVysledku
2
n5:rokUplatneniVysledku
n6:2009
n5:svazekPeriodika
103
n5:tvurceVysledku
Novotná, Pavlína Urbanová, Marie
n5:zamer
n13:MSM6046137307
s:issn
1213-7103
s:numberOfPages
5
n9:organizacniJednotka
22340