This HTML5 document contains 59 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n18http://localhost/temp/predkladatel/
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n10http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n17http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n13http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F00216224%3A14310%2F05%3A00012379%21RIV08-MSM-14310___/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n5http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n11http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F00216224%3A14310%2F05%3A00012379%21RIV08-MSM-14310___
rdf:type
n10:Vysledek skos:Concept
dcterms:description
Virulent and polyvalent staphylophage 812, a member of Myoviridae family, exhibits strong lytic activity on a broad host range of Staphylococcus species, thus being a suitable candidate for treatment of staphylococcal infections. Genome of this phage is represented by linear 145 kb dsDNA. Our study was focused on genome and proteome comparison of 812 wild-type phage, its host-range mutants and related phages U16, 131 and SK311 with the aim to explain molecular basis of differences in their host-range. Comparison of the phage genomes revealed several rearrangements of DNA sequences as well as single nucleotide substitutions in different parts of the genomes. Nucleotide insertions and deletions of various size (~1 to 3 kb) were most frequently found in non-coding terminal genomic regions in phages with different host range. We tried to find possible correlations between mutational changes on DNA and proteome composition of the phages. After SDS-PAGE separation of phage virions digests 15 protein bands w Bakteriofág 812, zástupce čeledi Myoviridae, je virulentní polyvalentní fág s širokým rozmezím hostitelů, zahrnujícím kmeny a druhy rodu Staphylococcus. Tyto vlastnosti jej činí vhodným kandidátem pro fágovou terapii stafylokokových infekcí. Tato práce byla zaměřena na srovnání genomu a proteomu standardního typu fága 812, jeho mutant v rozmezí hostitele a příbuzných fágů U16, SK311, 131 a Twort s cílem objastnit molekulární základ jejich rozdílného hostitelského rozmezí. Genomy uvedených fágů tvořené lineární dvouřetězcovou DNA o velikosti 145 kb byly srovnávány pomocí restrikční analýzy. Úseky vykazující u jednotlivých fágů rozdíly byly pak charakterizovány detailně. Pro účely proteomických studií byla použita 1-D SDS-PAGE. Nalezené proteiny byly identifikovány metodou peptidového mapování s využitím MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie. Srovnáním fágových genomů byly zjištěny vedle nukleotidových substitucí též rozsáhlejší přestavby sekvencí DNA. Inzerce a delece o velikosti ~1 až 3 kb byly nalezeny Bakteriofág 812, zástupce čeledi Myoviridae, je virulentní polyvalentní fág s širokým rozmezím hostitelů, zahrnujícím kmeny a druhy rodu Staphylococcus. Tyto vlastnosti jej činí vhodným kandidátem pro fágovou terapii stafylokokových infekcí. Tato práce byla zaměřena na srovnání genomu a proteomu standardního typu fága 812, jeho mutant v rozmezí hostitele a příbuzných fágů U16, SK311, 131 a Twort s cílem objastnit molekulární základ jejich rozdílného hostitelského rozmezí. Genomy uvedených fágů tvořené lineární dvouřetězcovou DNA o velikosti 145 kb byly srovnávány pomocí restrikční analýzy. Úseky vykazující u jednotlivých fágů rozdíly byly pak charakterizovány detailně. Pro účely proteomických studií byla použita 1-D SDS-PAGE. Nalezené proteiny byly identifikovány metodou peptidového mapování s využitím MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie. Srovnáním fágových genomů byly zjištěny vedle nukleotidových substitucí též rozsáhlejší přestavby sekvencí DNA. Inzerce a delece o velikosti ~1 až 3 kb byly nalezeny
dcterms:title
Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812 Genomic and proteomic characterization of polyvalent staphylococcal bacteriophage 812 Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812
skos:prefLabel
Genomic and proteomic characterization of polyvalent staphylococcal bacteriophage 812 Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812 Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812
skos:notation
RIV/00216224:14310/05:00012379!RIV08-MSM-14310___
n3:strany
7
n3:aktivita
n15:P n15:Z
n3:aktivity
P(GA203/03/0515), Z(MSM0021622415)
n3:cisloPeriodika
1
n3:dodaniDat
n11:2008
n3:domaciTvurceVysledku
n7:9236333 n7:3431525 n7:4186672 n7:9413359 n7:9725741 n7:3440656 n7:5051207 n7:4568567
n3:druhVysledku
n9:J
n3:duvernostUdaju
n5:S
n3:entitaPredkladatele
n13:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
512227
n3:idVysledku
RIV/00216224:14310/05:00012379
n3:jazykVysledku
n19:cze
n3:klicovaSlova
bacteriophage; phage therapy; MALDI-TOF; proteomics; genome
n3:klicoveSlovo
n4:proteomics n4:MALDI-TOF n4:bacteriophage n4:phage%20therapy n4:genome
n3:kodStatuVydavatele
CZ - Česká republika
n3:kontrolniKodProRIV
[3008179C4A7F]
n3:nazevZdroje
Informační listy Česko-Slovenské genetické společnosti Gregora Mendela.
n3:obor
n14:EB
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
8
n3:pocetTvurcuVysledku
8
n3:projekt
n12:GA203%2F03%2F0515
n3:rokUplatneniVysledku
n11:2005
n3:svazekPeriodika
28
n3:tvurceVysledku
Preisler, Jan Zdráhal, Zbyněk Pantůček, Roman Růžičková, Vladislava Eyer, Luděk Kašpárek, Petr Konečná, Hana Doškař, Jiří
n3:zamer
n17:MSM0021622415
s:issn
1210-6267
s:numberOfPages
1
n18:organizacniJednotka
14310