This HTML5 document contains 44 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n13http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/typAkce/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n7http://localhost/temp/predkladatel/
n3http://purl.org/net/nknouf/ns/bibtex#
n12http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00011469%21RIV08-GA0-14310___/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n9http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n8http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n18http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00011469%21RIV08-GA0-14310___
rdf:type
skos:Concept n16:Vysledek
dcterms:description
Quality of two-dimensional (2D) electrophoresis is dependent on the way of sample preparation. The aim of this study was to set up optimal conditions for preparation of the sample of v-myb-transformed chicken BM2 monoblasts to get a high number of resolved proteins in 2D gel. Starting composition of both lysis (9 M urea, 2 % NP-40, 3 % CHAPS, 70 mM DTT and 2 % ampholyte pH 8-10.5) and rehydratation buffers (8 M urea, 4 % CHAPS, 100 mM DTT, 0.001 % bromphenol blue and 0.2 % ampholyte pH 3-10) have been modified by addition of thiourea causing clear increase of the number of protein spots detectable in 2D gel. In addition, sonication of the sample further increased the number and density of resolved proteins. The presence of thiourea in the lysis/rehydratation buffers and sonication increased the number of protein spots resolved in 2D gel about 8-fold. These experimental conditions are going to be used in analysis of proteome during terminal differentiation of BM2 monoblasts. Výsledek dvourozměrné elektroforézy (2D) proteinů výnamně závisí na způsobu přípravy vzorku. Cílem této práce bylo stanovit optimální podmínky pro přípravu vzorku kuřecích monoblastů transormovaných onkogenem v-myb. Modifikací lyzačního (9 M urea, 2 % NP-40, 3 % CHAPS, 70 mM DTT, 2 % ampholyte pH 8-10.5) a rehydratačního pufru (8 M urea, 4 % CHAPS, 100 mM DTT, 0.001 % bromphenol blue, 0.2 % ampholyte pH 3-10)přidáním thiomočoviny jsme zřetelně zvýšili počet proteinů rozlišitelných v 2D gelu. Sonikací vzorku jsme dále zvýšili počet a densitu proteinů na elektroforetogramu. Přítomnost thiomočoviny v lyzačním/rehydratačním pufru a sonikace zvýšila počet rozlišitelných proteinových skvrn přibližně osmkrát. Tyto experimentální podmínky použijeme při analýze proteomu během diferenciace monoblastů BM2. Výsledek dvourozměrné elektroforézy (2D) proteinů výnamně závisí na způsobu přípravy vzorku. Cílem této práce bylo stanovit optimální podmínky pro přípravu vzorku kuřecích monoblastů transormovaných onkogenem v-myb. Modifikací lyzačního (9 M urea, 2 % NP-40, 3 % CHAPS, 70 mM DTT, 2 % ampholyte pH 8-10.5) a rehydratačního pufru (8 M urea, 4 % CHAPS, 100 mM DTT, 0.001 % bromphenol blue, 0.2 % ampholyte pH 3-10)přidáním thiomočoviny jsme zřetelně zvýšili počet proteinů rozlišitelných v 2D gelu. Sonikací vzorku jsme dále zvýšili počet a densitu proteinů na elektroforetogramu. Přítomnost thiomočoviny v lyzačním/rehydratačním pufru a sonikace zvýšila počet rozlišitelných proteinových skvrn přibližně osmkrát. Tyto experimentální podmínky použijeme při analýze proteomu během diferenciace monoblastů BM2.
dcterms:title
Příprava vzorku pro analýzu proteomu leukemických buněk BM2 dvourozměrnou elektroforézou Sample preparation for proteom analysis of leukemic cells BM2 using two-dimensional electrophoresis Příprava vzorku pro analýzu proteomu leukemických buněk BM2 dvourozměrnou elektroforézou
skos:prefLabel
Sample preparation for proteom analysis of leukemic cells BM2 using two-dimensional electrophoresis Příprava vzorku pro analýzu proteomu leukemických buněk BM2 dvourozměrnou elektroforézou Příprava vzorku pro analýzu proteomu leukemických buněk BM2 dvourozměrnou elektroforézou
skos:notation
RIV/00216224:14310/04:00011469!RIV08-GA0-14310___
n4:strany
24
n4:aktivita
n14:P
n4:aktivity
P(GA301/03/1055)
n4:dodaniDat
n18:2008
n4:domaciTvurceVysledku
n12:9039058 n12:6659446
n4:druhVysledku
n17:D
n4:duvernostUdaju
n8:S
n4:entitaPredkladatele
n10:predkladatel
n4:idSjednocenehoVysledku
581939
n4:idVysledku
RIV/00216224:14310/04:00011469
n4:jazykVysledku
n20:cze
n4:klicovaSlova
Two-dimensional electrophoresis; proteome analysis; sample preparation
n4:klicoveSlovo
n9:Two-dimensional%20electrophoresis n9:sample%20preparation n9:proteome%20analysis
n4:kontrolniKodProRIV
[2DB3AE63D870]
n4:mistoKonaniAkce
Mělník
n4:mistoVydani
Mělník
n4:nazevZdroje
1. česká proteomická konference
n4:obor
n6:FD
n4:pocetDomacichTvurcuVysledku
2
n4:pocetTvurcuVysledku
2
n4:projekt
n5:GA301%2F03%2F1055
n4:rokUplatneniVysledku
n18:2004
n4:tvurceVysledku
Šmarda, Jan Váňa, Petr
n4:typAkce
n13:CST
n4:zahajeniAkce
2004-06-15+02:00
s:numberOfPages
1
n3:hasPublisher
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR. Středisko vědeckotechnických informací
n7:organizacniJednotka
14310