This HTML5 document contains 58 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n18http://localhost/temp/predkladatel/
n11http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n7http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n5http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n8http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00010234%21RIV09-GA0-14310___/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n15http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n12http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n16http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n6http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n13http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00010234%21RIV09-GA0-14310___
rdf:type
skos:Concept n19:Vysledek
dcterms:description
Z konzervativních sekvencí genomů Staphylococcus aureus bakteriofágových druhů 3A, P11-M15, 77, 187 a Twort reprezentujících fágové seroskupiny A, B, F, L a D bylo navrženo 5 párů primerů, jeden pro každý fágový druh. Pro fágový druh 77 reprezentovaný fágy phi13 a phi77 byly navrženy další dva páry primerů umožňující diferenciaci dvou odlišných fágových kmenů serologické skupiny F integrovaných současně v genomu. Byla zavedena metoda multiplex-PCR a uzpůsobena tak, aby umožnila identifikaci fágů těchto druhů a detekci profágů v genomech S. aureus v reakci v jedné zkumavce. U experimentálně lyzogenizovaných kmenů S. aureus 8325-4 fágy phi11, phi47, phi53, phi84, phi85, phi77 a S. aureus 8325 fágem phi77 se touto metodou podařilo detekovat současně jednoho až čtyři odlišné profágy. Metoda umožňuje přiřadit k fágovému druhu a současně k serologické skupině 23 fágů Mezinárodní standardní řady pro fagotypizaci. Také všechny profágy odhalené v sekvencovaných genomech S. aurues (8325, Mu50, N315, MW2, COL, M Conserved genomic sequences distinctive of Staphylococcus aureus phage species 3A, 11, 77, 187 and Twort, representative of phage serogroups A, B, F, L and D, were identified and characterized. PCR primers designed for the above sequences were used for development of a multiplex PCR assay which enabled us not only to classify all phages of the International Typing Set plus 16 additional phages to species, but also to detect prophages in S. aureus genomes. One to four different prophages were unambiguously detected in experimentally lysogenized S. aureus strains, and substantial variation in prophage content was found in 176 S. aureus clinical strains of different provenance. In addition, by using a comparative genomics approach, all the prophages in the S. aureus genomes sequenced to date could be revealed and classified to phage species Conserved genomic sequences distinctive of Staphylococcus aureus phage species 3A, 11, 77, 187 and Twort, representative of phage serogroups A, B, F, L and D, were identified and characterized. PCR primers designed for the above sequences were used for development of a multiplex PCR assay which enabled us not only to classify all phages of the International Typing Set plus 16 additional phages to species, but also to detect prophages in S. aureus genomes. One to four different prophages were unambiguously detected in experimentally lysogenized S. aureus strains, and substantial variation in prophage content was found in 176 S. aureus clinical strains of different provenance. In addition, by using a comparative genomics approach, all the prophages in the S. aureus genomes sequenced to date could be revealed and classified to phage species
dcterms:title
Identification of bacteriophage types and their carriage in <I>Staphylococcus aureus</I> Identifikace typů bakteriofágů a profágů u Staphylococcus aureus Identification of bacteriophage types and their carriage in <I>Staphylococcus aureus</I>
skos:prefLabel
Identifikace typů bakteriofágů a profágů u Staphylococcus aureus Identification of bacteriophage types and their carriage in <I>Staphylococcus aureus</I> Identification of bacteriophage types and their carriage in <I>Staphylococcus aureus</I>
skos:notation
RIV/00216224:14310/04:00010234!RIV09-GA0-14310___
n3:aktivita
n15:P n15:Z
n3:aktivity
P(GA203/03/0515), P(GA301/02/1505), Z(MSM 143100008)
n3:cisloPeriodika
9
n3:dodaniDat
n13:2009
n3:domaciTvurceVysledku
n7:4186672 n7:7675011 n7:9138498 n7:5051207 n7:3647706 n7:9413359 n7:3440656
n3:druhVysledku
n16:J
n3:duvernostUdaju
n17:S
n3:entitaPredkladatele
n8:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
567141
n3:idVysledku
RIV/00216224:14310/04:00010234
n3:jazykVysledku
n12:eng
n3:klicovaSlova
Staphylococcus aureus bacteriophages; lysogeny; prophage detection; multiplex PCR; bacteriophage genomics
n3:klicoveSlovo
n4:lysogeny n4:prophage%20detection n4:Staphylococcus%20aureus%20bacteriophages n4:multiplex%20PCR n4:bacteriophage%20genomics
n3:kodStatuVydavatele
AT - Rakouská republika
n3:kontrolniKodProRIV
[0289B2F024D6]
n3:nazevZdroje
Archives of Virology
n3:obor
n6:EB
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
7
n3:pocetTvurcuVysledku
7
n3:projekt
n11:GA203%2F03%2F0515 n11:GA301%2F02%2F1505
n3:rokUplatneniVysledku
n13:2004
n3:svazekPeriodika
149
n3:tvurceVysledku
Oráčová, Eva Rosypal, Stanislav Pantůček, Roman Doškař, Jiří Růžičková, Vladislava Kvardová, Veronika Kašpárek, Petr
n3:wos
000223910100002
n3:zamer
n5:MSM%20143100008
s:issn
0304-8608
s:numberOfPages
15
n18:organizacniJednotka
14310