This HTML5 document contains 56 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
n18http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/typAkce/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
n21http://localhost/temp/predkladatel/
n13http://purl.org/net/nknouf/ns/bibtex#
n16http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/
n10http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/riv/tvurce/
n19http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/
n15http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/zamer/
n12https://schema.org/
shttp://schema.org/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
n3http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/
n2http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n14http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/klicoveSlovo/
n20http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/duvernostUdaju/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n17http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/aktivita/
n4http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/jazykVysledku/
n11http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/druhVysledku/
n22http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/riv/obor/
n6http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/vysledek/RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00009921%21RIV08-MSM-14310___/
n8http://reference.data.gov.uk/id/gregorian-year/

Statements

Subject Item
n2:RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00009921%21RIV08-MSM-14310___
rdf:type
skos:Concept n19:Vysledek
dcterms:description
Bakteriofág 812 je polyvalentní stafylokokový fág, lyzující široké spektrum druhů rodu Staphylococcus, převážně pak kmeny druhu S. aureus. Pro své lytické vlastnosti je vhodným kandidátem pro fágovou terapii, při níž jsou bakteriofágy využívány pro léčbu stafylokokových infekcí, převážně těch, které jsou vyvolány kmeny rezistentními k antibiotikům. V této práci se zaměřujeme na analýzu fágového proteomu, a to především na strukturní a lytické proteiny, které mají vztah k rozmezí hostitele. Fág 812 byl pomnožen na kmeni S. aureus SA812, purifikován ultracentrifugací v gradientu CsCl a dialyzován proti vodě. DNA uvolněná z fágových částic byla odstraněna DNázou I. Fágové proteiny byly denaturovány krátkodobým povařením s pufrem obsahujícím SDS a DTT a analyzovány jednorozměrnou elektroforézou na polyakrylamidovém gelu. Po obarvení gelu pomocí Coomassie brilliant blue a stříbra jsme nalezli 6 výrazných pruhů, které jsme vyřízli z gelu, podrobili štěpení trypsinem na specifické peptidy a dále analyzovali Virulent and polyvalent staphylophage 812, a member of Myoviridae family, exhibits strong lytic activity on a broad host range of Staphylococcus species, thus being a suitable candidate for treatment of staphylococcal infections. Genome of this phage is represented by linear 145 kb dsDNA. Our study was focused on genome and proteome comparison of 812 wild-type phage, its host-range mutants and related phages U16, 131 and SK311 with the aim to explain molecular basis of differences in their host-range. Comparison of the phage genomes revealed several rearrangements of DNA sequences as well as single nucleotide substitutions in different parts of the genomes. Nucleotide insertions and deletions of various size (~1 to 3 kb) were most frequently found in non-coding terminal genomic regions in phages with different host range. We tried to find possible correlations between mutational changes on DNA and proteome composition of the phages. After SDS-PAGE separation of phage virions digests 15 protein bands w Bakteriofág 812 je polyvalentní stafylokokový fág, lyzující široké spektrum druhů rodu Staphylococcus, převážně pak kmeny druhu S. aureus. Pro své lytické vlastnosti je vhodným kandidátem pro fágovou terapii, při níž jsou bakteriofágy využívány pro léčbu stafylokokových infekcí, převážně těch, které jsou vyvolány kmeny rezistentními k antibiotikům. V této práci se zaměřujeme na analýzu fágového proteomu, a to především na strukturní a lytické proteiny, které mají vztah k rozmezí hostitele. Fág 812 byl pomnožen na kmeni S. aureus SA812, purifikován ultracentrifugací v gradientu CsCl a dialyzován proti vodě. DNA uvolněná z fágových částic byla odstraněna DNázou I. Fágové proteiny byly denaturovány krátkodobým povařením s pufrem obsahujícím SDS a DTT a analyzovány jednorozměrnou elektroforézou na polyakrylamidovém gelu. Po obarvení gelu pomocí Coomassie brilliant blue a stříbra jsme nalezli 6 výrazných pruhů, které jsme vyřízli z gelu, podrobili štěpení trypsinem na specifické peptidy a dále analyzovali
dcterms:title
Proteome analysis of the polyvalent bacteriophage 812 Analýza proteomu polyvalentního bakteriofága 812 Analýza proteomu polyvalentního bakteriofága 812
skos:prefLabel
Proteome analysis of the polyvalent bacteriophage 812 Analýza proteomu polyvalentního bakteriofága 812 Analýza proteomu polyvalentního bakteriofága 812
skos:notation
RIV/00216224:14310/04:00009921!RIV08-MSM-14310___
n3:strany
45-46
n3:aktivita
n17:P n17:Z
n3:aktivity
P(GA203/03/0515), Z(MSM 143100008)
n3:dodaniDat
n8:2008
n3:domaciTvurceVysledku
n10:4568567 n10:3431525 n10:9725741 n10:3440656 n10:5051207 n10:9236333
n3:druhVysledku
n11:D
n3:duvernostUdaju
n20:S
n3:entitaPredkladatele
n6:predkladatel
n3:idSjednocenehoVysledku
554523
n3:idVysledku
RIV/00216224:14310/04:00009921
n3:jazykVysledku
n4:cze
n3:klicovaSlova
bacteriophage proteomics; MALDI-TOF; therapeutic bacteriphage; Staphylococcus bacteriophage
n3:klicoveSlovo
n14:bacteriophage%20proteomics n14:therapeutic%20bacteriphage n14:Staphylococcus%20bacteriophage n14:MALDI-TOF
n3:kontrolniKodProRIV
[F76A2BB836EE]
n3:mistoKonaniAkce
Brno
n3:mistoVydani
Brno
n3:nazevZdroje
VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník abstraktů
n3:obor
n22:EB
n3:pocetDomacichTvurcuVysledku
6
n3:pocetTvurcuVysledku
6
n3:projekt
n16:GA203%2F03%2F0515
n3:rokUplatneniVysledku
n8:2004
n3:tvurceVysledku
Konečná, Hana Pantůček, Roman Preisler, Jan Doškař, Jiří Zdráhal, Zbyněk Eyer, Luděk
n3:typAkce
n18:CST
n3:zahajeniAkce
2004-02-03+01:00
n3:zamer
n15:MSM%20143100008
s:numberOfPages
2
n13:hasPublisher
Masarykova univerzita v Brně
n12:isbn
80-210-3321-5
n21:organizacniJednotka
14310